差异表达基因检测不仅具有统计学意义,而且具有生物学意义,在医学临床诊断、药物疗效判断、揭示疾病发生机制等方面都有重要的作用。在医学研究中,癌症差异表达基因检测就是一个重要的问题。差异表达基因检测统计方法的目的是识别由于实验环境变化而引起的表达水平改变的基因[43]。在基因芯片数据分析中,差异表达基因检测的传统方法通常是假定所有癌症组样本相对于正常组样本都具有过高或过低的表达。......
2023-11-21
MEMS数字检波器目前主要有VectorSeis系列和DSU系列。前者是美国I/O公司1999年前后推出的Vector Seis三分量数字地震检波器;后者是法国舍赛尔公司2003年推出的全数字地震数据采集系统,分为DSU1和DSU3两种。迄今为止,数字检波器的试验、生产已经取得了很多有意义的经验、结论,但也存在一些偏差与误区。
MEMS数字检波器较传统的动圈式检波器在性能指标方面有了很大的进步,也呈现出了不同的数据特征,但是从实践角度来讲,却并没有最终表现为地球物理及地质效果的大幅进步,进而得以大面积推广。在野外施工中占主导的,仍然是10Hz动圈式检波器。所以,除了商业因素以外,有必要从基础数据的角度入手,进一步深入分析两种典型检波器采集到的数据之间的差异,找到这种现象背后的原因。
作者认为,如果仅仅从表3-2的性能指标对比来看,DSU3无疑取得了进步。但是这种对比存在两个问题:①部分指标没有比较,比如耦合能力方面;②部分较高的指标参数没有在“从地面震动到磁带数据的映射”中得以体现。比如DSU3数字检波器0~800Hz的频率和相位响应,因为有效反射波频率低(低于150~200Hz)而难以充分发挥作用。检波器的高指标没有转换为地震数据的高质量。(www.chuimin.cn)
表3-2 两种代表性检波器(DSU3、20dx)的性能指标对比
为了深入对比数字检波器与模拟检波器的数据效果,笔者于2010年年初在某油田HJ地区采用法国舍赛尔公司产428XL地震仪以及DSU3数字检波器、20dx模拟检波器进行了一个野外对比试验。在试验数据的基础上,对两种检波器的性能指标差异与地球物理效果之间的关系进行了分析,以期找到两者之间的关联,进一步明确石油地震勘探对检波器的地球物理要求。
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2023-11-21
Tomlins等人在2005年提出了COPA方法,用于检测癌症组样本一小部分基因相对于正常组样本过表达的差异表达基因检测[101],许多学者由此受到启发,截至2010年9月13日,该文章的引用次数已经达到了763次。David A.Hanauer指出在不久的将来,COPA差异表达基因检测方法会提供较多的与癌症发生演化相关的重要基因,从而为揭开癌症的神秘面纱贡献力量[102]。通过模拟研究和应用到公共基因芯片数据,表明以上成果为综合分析和提高传统差异表达基因检测提供了方法。......
2023-11-21
在国外涉及较早的变点研究是突变点,对于渐变式变点的研究也有一些结论,对于位置参数模型提出了变点的最小二乘法的估计。最小二乘法就是以观察值和理论值之差的平方和作为目标函数,将其达到极小值的点作为有关参数的点估计[8]。给出衡量最小二乘法识别多差异表达基因检测突变点能力的方法,模拟研究最小二乘法对不同具有差异表达基因的基因表达谱数据生成过程的多差异表达基因变点检测效果[10]。......
2023-11-21
每个Reads片段都对应了一个基因的某个转录本,所以通过将Reads序列Mapping到参考基因组序列上,继而根据该参考基因组已有的基因注释信息,推定出各个基因在转录组中对应的表达量的高低。Reads序列Mapping的结果往往存储在Sam文件或者Bam文件中[180,181]。......
2023-11-21
RNA-Seq测序技术已成为研究基因表达的重要实验手段,比较不同样本中基因表达差异,为解决后续的生物问题提供了定量分析的依据。生物信息学科的研究工作者近年来也意识到了大数据带来的挑战,开发了一些基于云计算的分析软件,其中涉及RNA-Seq数据分析的主要有MyRNA、Crossbow等。本部分的研究即将要构建的基因差异表达分析流程就是针对RNA-Seq技术得到的原始数据进行设计和实现的。......
2023-11-21
在差异表达基因检测统计方法中,传统的T统计方法假设所有癌症组样本相对于正常组样本都是过表达的。Wu在2007年提出的ORT方法对OS方法进行了改进。Lian在2008年提出的MOST方法考虑了差异基因表达所有可能的临界值。当活跃样本数目未知时,MOST方法比其他方法更有效;当活跃样本数目较少时,其效果与ORT方法相似;当差异表达的样本数目较多时,MOST方法的效果较好[103]。......
2023-11-21
差异表达基因检测普遍采用的方法是计算T统计方法,T统计方法通过两组样本的均值来判断基因是否存在表达差异。差异基因表达检测研究通过在不同实验条件下基因表达水平的显著性变化来判断基因的差异性,通常采用假设检验原理,把样本分为正常组样本和癌症组样本两类,或者分为两种条件下的多次重复试验,并对此进行判断。T统计方法通常用于检测两组样本均值的显著差异性,在差异基因表达检测中,它也是常用的较简洁的统计方法。......
2023-11-21
《普通高中数学课程标准(2017年版)》指出:数据分析是研究随机现象的重要数学技术,是大数据时代数学应用的主要方法,也是“互联网+”相关领域的主要数学方法,数据分析已经深入到科学、技术、工程和现代社会生活的各个方面.通过高中数学课程的学习,学生能提升获取有价值信息并进行定量分析的意识和能力;适应数字化学习的需要,增强基于数据表达现实问题的意识,形成通过数据认识事物的思维品质,积累依托数据探索事物本......
2023-08-17
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