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食品酶学导论:酶蛋白合成过程解析

【摘要】:酶或蛋白质合成过程包括氨基酸活化、肽链合成的起始、肽链的延伸、肽链合成的终止和肽链的加工修饰等过程。原核细胞和真核细胞的酶或蛋白质合成过程基本相同,但也有区别之处。其中tRNAf用来与fMet相结合,参与肽链合成的起始作用;tRNAm携带正常的甲硫氨酸进入肽链。图6-9 多肽链合成过程(四)肽链的络止当mRNA上终止密码出现后,多肽链合成停止,肽链从肽酰-tRNA中释出,mRNA、核蛋白体等分离,这些过程称为肽链合成终止。

酶或蛋白质合成过程包括氨基酸活化、肽链合成的起始、肽链的延伸、肽链合成的终止和肽链的加工修饰等过程。原核细胞和真核细胞的酶或蛋白质合成过程基本相同,但也有区别之处。

(一)氨基酸活化

氨基酸是蛋白质合成的主要原料,而氨基酸在蛋白质合成前首先要活化,即在氨基酰-tRNA(AA-tRNA)合成酶的催化下进行活化,其所需能量由细胞内ATP提供。细胞内tRNA有几十种,每一个tRNA能专一地运送一种氨基酸,而一种氨基酸可分别被几种tRNA专一运送,这一过程是由细胞内氨基酰-tRNA合成酶所催化的。如大肠杆菌E.coli)异亮氨酰tRNA合成酶分子质量为118000u,为一个多肽链;甲硫氨酰tRNA合成酶分子质量为180000u,为两个亚单位即两条多肽链,均具有专一催化作用。

氨基酸活化过程分两步,第一步:氨基酸+ATP+E→氨基酰-AMP-E+PPi;第二步:氨基酰-AMP-E+tRNA→氨基酰-tRNA+AMP+E。如图6-5(1)、(2)所示。

图6-5 氨基酸活化过程

(二)多肽链合成的起始

多肽链合成的起始密码多数为AUG(少数为GUG),起始氨基酸为甲酰甲硫氨酸(fMet),但并不是以甲硫氨酰-tRNA作起始物,而是以N-甲酰甲硫氨酰-tRNA(fMet-tRNAf)的形式起始。细胞内携带甲硫氨酸的tRNA有两种:tRNAf和tRNAm。其中tRNAf用来与fMet相结合,参与肽链合成的起始作用;tRNAm携带正常的甲硫氨酸进入肽链。细胞内有一种甲酰化酶可以催化N-甲酰甲硫氨酰-tRNA的形成,甲硫氨酸的α-NH2被甲基化。这种甲酰化酶只能催化Met-tRNAf,而不能催化游离的甲硫氨酸或Met-tRNAm甲酰化。

起始过程如下:

(1)30S亚基与模板mRNA结合形成30S-mRNA复合物。

(2)30S-mRNA复合物在起始因子(initiative factor)IF3参与下形成30S-mRNA-IF3复合物(分子比为1∶1∶1)。IF3分子质量为23000u,能促进30S与mRNA链上起始密码结合,也能促进70S的解离(图6-6)。

图6-6 30S-mRNA-IF3复合物

(3)在tRNAfMet、GTP、IF1、IF2的参与下形成30S起始复合物:30S-mRNA-tRNAfMet-GTP-IF1-IF2,并释放IF3(图6-7)。

图6-7 30S起始复合物

(4)30S起始复合物与50S亚基相结合,形成一个有生物学功能的70S起始复合物,同时GTP水解成GDP和Pi,释放出IF1和IF2(图6-8)。

图6-8 70S起始复合物

(5)这时,fMet-tRNAf占据了核糖体上的肽酰位点(P位点),空着的氨酰-tRNA位点(A位点)准备接受另一个氨酰-tRNA,为肽链延伸做好了准备。

(三)肽链合成的延伸

肽链合成的延伸过程如图6-9(1)和(2)所示。

(1)肽链的延伸(elongation)在延伸因子(elongation fator)EFTu和在GTP、第二个tR-NA-AA参与下形成70S-tRNAfMet-mRNA复合物。

(2)在转肽酶(peptidyl transferase)作用下形成一个肽链连接的二肽衍生复合物。(www.chuimin.cn)

(3)70S位移一个三联体密码,具有肽键的tRNA由A位移至P位。移位的结果使原来在A位点上的肽酰-tRNA又回到P位点上,原来在P位点上的无负载的tRNA离开核糖体。移位反应需要延伸因子G(EFG),也称移位酶(translocase),移位还需要GTP参与提供能量。

(4)第2个携带AA的tRNA进入A位,然后再位移形成第二个肽键连接的三肽衍生物。肽链延伸过程每重复一次,肽链就伸长一个氨基酸的长度

图6-9 多肽链合成过程

(四)肽链的络止

(1)当mRNA上终止密码出现后,多肽链合成停止,肽链从肽酰-tRNA中释出,mRNA、核蛋白体等分离,这些过程称为肽链合成终止。mRNA上肽链合成终止密码子为:UAA、UAG、UGA。

(2)肽链合成的终止包括两步:①对mRNA上终止信号的识别;②完工的肽酰-tRNA酯键的水解,以便使新合成的肽链释放出来。

(3)肽链的终止是在终止因子或释放因子(releast factor)参与及其辅助因子S、TR的作用下进行的。

(4)终止因子或释放因子包括:RF1、RF2、RF3。RF1用以识别密码子UAA、UAG。RF2帮助识别UAA、UAG。RF3不识别任何终止密码子,但能协助肽链释放。RF1和RF2可能使P位点上的肽酰转移酶活力转为水解活力。

真核细胞蛋白质合成的机理与原核细胞十分相似,但某些步骤更为复杂,涉及的调控因子更多,区别在于:

(1)真核细胞的核糖体更大。

(2)真核细胞多肽合成的起始氨基酸为甲硫氨酸,而不是N-甲酰甲硫氨酸,即起始tR-NA为Met-tRNA。

(3)真核细胞多肽合成的起始密码子为AUG,真核细胞mRNA通常只有一个AUG密码子。

(4)真核细胞与原核细胞在合成多肽链时延长因子不同。

原核生物和真核生物酶生物合成的5个阶段的必需组分如表6-1所示。

表6-1 酶生物合成各阶段的必需组分

续表

在多聚核糖体由模板mRNA和tRNA、酶和辅助因子作用下形成的多肽,通过脱甲酰酶和氨肽酶的作用,对新合成多肽进行分子修饰,形成特定构象具有功能性的天然蛋白质。

电子显微镜可观察到多聚核糖体(polyribosome),它是一条mRNA,可以结合多个核糖体,许多核糖体连接起来而形成纤细的mRNA线段。然而,每一个单独的核糖体是独立起作用的,并不依赖其他核糖体的存在。多聚核糖体结构及其作用如图6-10所示。

图6-10 多聚核糖体结构示意图