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科学数据管理与共享:关联服务提供途径

【摘要】:在此政策环境下,期刊文献支撑数据的定向存储成为重要的关联服务提供途径。商业数据库对关联服务的参与商业数据库作为传统的科学文献,特别是科学期刊文献的重要存储和提供渠道,逐渐开始重视科学期刊与支撑数据之间的关联服务,其中Elsevier是较早尝试此类服务且较为典型的商业数据库商。

当前,科研人员存储或出版科学数据主要有两种途径,将科学数据存储在机构或者期刊方提供的科学数据存储库中,或者通过新兴的科学数据期刊出版科学数据文章的形式出版。在此基础上,期刊文献与科学数据之间的关联可通过期刊、期刊库或商业数据库、科学数据仓储等不同载体之间的关联实现。

(1)期刊与科学数据之间的互联

众多期刊对其所发表文献的支撑数据提出定向存储、共享或开放存取的要求。期刊科学数据政策(Journal Research Data Policy Bank,JoRD)项目针对400种期刊的科学数据政策调查发现,其中约一半的期刊对科学数据的存储、共享、复用等相关问题进行了政策规定[133]。通过科学研究期刊支撑数据的定向的存储,建立期刊文献与特定科学数据仓储之间的互动关联,可追踪特定科学期刊文献的原始研究数据,提供查询、引用和复用等。众多期刊设立了定向存储科学数据的相关政策,建立其科学期刊文献、原始科学数据与科学数据仓储之间的有序关联。在此政策环境下,期刊文献支撑数据的定向存储成为重要的关联服务提供途径。部分生物学、医学、基因学、地理科学等数据产量大的学科领域的科学期刊为期刊文献的作者提供了科学数据仓储,用以存储该期刊文献的支撑数据和辅助材料。如美国地理协会(The Geological Society of America,GSA)的GSA Data Repository专门用以存储其出版的科学期刊的支撑数据。此外,包括《自然》《美国自然学家》等在内的32种期刊遵循联合数据存档政策(Joint Data Archiving Policy,JDAP),将Dryad科学数据仓储等作为共同的指定科学数据存储库[134]。不同的学科类型的期刊对科学数据的存储仓储有不同的规定,同时各有交叉,形成丰富的期刊与科学数据仓储的关联关系。

(2)商业数据库对关联服务的参与

商业数据库作为传统的科学文献,特别是科学期刊文献的重要存储和提供渠道,逐渐开始重视科学期刊与支撑数据之间的关联服务,其中Elsevier是较早尝试此类服务且较为典型的商业数据库商。Elsevier鼓励作者将期刊文献的原始科学数据存储在特定的科学数据仓储中,同时Elsevier支持四种方式的科学数据与科学期刊文献的关联,包括公共科学数据仓储提供的科学数据标签符号或获取号码的识别、数字对象识别符(Digital Object Identifier,DOI)的链接、相关科学数据仓储标志的提供与链接、科学数据可视化与整合的相关应用等[135]。这四种方式面向不同的科学数据标识方式,提供便利追溯或链接方式,有效地实现了科学数据与科学文献之间的关联以及科学数据的复用。如当文章中包含DOI识别符时,Elsevier可自动将DOI所指向的科学数据链接引入ScienceDirect数据库[136]。当前Elsevier与包括基因数据库GenBank、蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB)、地理数据仓储PANGAEA等在内10余个学科领域的30多个数据仓储合作,并在不断拓展数据仓储合作者。(www.chuimin.cn)

(3)科学数据期刊的发行

科学数据期刊的出现与发行为科学数据转向公开获取提供了崭新的平台,是科学数据发布和出版的重要方式,同时也是提供科学文献与科学数据关联服务的重要途径。据调查,目前已经有大量科学数据期刊发行[137]。科学数据期刊《地球系统科学数据》(Earth System Science Data)出版数据文章,相关的数据集则存储在其他数据仓储中[138];《地球化学、地球物理学、地球系统》(Geochemistry,Geophysics,Geosystems,G3)出版数据的摘要[139];Wiley公司与皇家气象学会合作推出开放存取期刊《地理科学数据期刊》(Geoscience Data Journal,GDJ),用以在线出版简短的地理科学数据论文,用以关联已存储在数据中心的数据以及授权DOI的数据集等[140];2014年5月,Nature推出科学数据期刊Scientific Data,用以实现相关文章支撑数据的出版、保存以及通过与文章的关联实现科学数据的复用[141]

除此之外,部分科学数据仓储如Dryad支持科学数据与其支撑期刊文献的关联性提交和存储,部分阅读工具如Utopia Documents实现了对科学文献与支撑数据之间的关联。