COPA方法是基于癌症组样本数据的第r分位数来确定差异基因表达值的。OS方法计算OS*i统计量，并且引入启发式规则附加表达值，利用分位数的知识对基因芯片数据进行基因表达的差异表达基因检测。在式中，差异表达基因的数量默认为个。COPA方法、OS方法、ORT方法和MOST方法的共同特点是以参数方法，采用样本基因表达强度的中值和中值绝对离差定义差异基因表达的统计量，都利用基因表达的分位数检测差异基因表达。......
2023-11-21
基于似然性方法检测差异基因的研究成果
【摘要】：Hu在2008年提出了LRS方法，LRS方法是基于似然性方法在基因表达谱数据中寻找癌症组样本基因表达强度的改变点，识别有差异表达的癌症基因，选取最大似然率进行癌症组样本检测。，n时，xij表示癌症组样本的基因表达强度。采用函数v＝，其中Φ表示标准正态分布函数，对于0≤m0＜m1＜n和b＞0，则有直接将LRS方法应用在相反的情况下，检测癌症组样本中过低调节的差异基因表达值。
Hu在2008年提出了LRS方法，LRS方法是基于似然性方法在基因表达谱数据中寻找癌症组样本基因表达强度的改变点，识别有差异表达的癌症基因，选取最大似然率进行癌症组样本检测。微阵列基因表达谱数据g×n矩阵包含g行基因，n列样本，样本中的数据满足正态分布。令i表示基因，i＝1，2，…，g。n表示样本数目，正常组样本有n1个，癌症组样本有n2个，则n＝n1+n2。j表示样本，xij表示样本表达强度，当j＝1，2，…，n1时，xij表示正常组样本基因表达强度；当j＝n1+1，n1+2，…，n时，xij表示癌症组样本的基因表达强度。令x1，…，xj，…，xn是独立的随机变量，满足x1，…，xn1 iid.～F1，xj，…，xn iid.～F2，其中F1为已知的正常组样本，F2为未知的癌症组样本，F1和F2是两个不相等的连续正态分布函数。令变点发生在第j个样本，j（1≤j＜n）或j／n（记为t0）为序列x1，…，xj，…，xn的变点。令原假设和对立假设为：
即x1，…，xj，…，xn有相同的分布，存在某个x0∈（0，1）使得F1（x0）≠F2（x0）。
考虑癌症组样本中存在过高表达，则正常组样本就排在癌症组样本前面，将样本按xi1，xi2，…，xin1，xi（n1+1），xi（n1+2），…，xin排序，癌症组样本按它们的表达强度递增排序xi2，表示为xi（n1+1），xi（n1+2），…，xin。所有样本表达强度的和为：
LRS方法假设的计算公式如下：(www.chuimin.cn)
式中，Sj是前j个样本的表达强度之和。根据经验我们只关心癌症组样本中变点的表达强度，把下界m0降为n1+1，上界m1提高到n-1。采用函数v（x）＝
，其中Φ表示标准正态分布函数，对于0≤m0＜m1＜n和b＞0，则有
直接将LRS方法应用在相反的情况下，检测癌症组样本中过低调节的差异基因表达值。
有关差异表达基因检测数据分析研究的文章
- 详细阅读
-
基于VaR的可信性评估方法-研究成果详细阅读
图4.13是VaR的概念简图。4）VaR的最大优点在于测量的综合性，可以将不同市场因子，不同市场的风险集成为一个数，较准确地测量由不同风险来源及其相互作用产生的潜在损失，较好地适应了金融市场发展的动态性、复杂性和全球化趋势。参数分析法是最常用的VaR计算方法。作为总结，表4.12比较了三种经典VaR计算方法应用于实践时的效率。表4.12 VaR计算方法比较3.VaR与可信性等级除去时间的影响，金融学上VaR的含义与M&S可信性评估定义中R的含义一致。......
2023-08-15
-
基于差异表达基因检测数据分析的方法介绍详细阅读
在差异表达基因检测统计方法中，传统的T统计方法假设所有癌症组样本相对于正常组样本都是过表达的。Wu在2007年提出的ORT方法对OS方法进行了改进。Lian在2008年提出的MOST方法考虑了差异基因表达所有可能的临界值。当活跃样本数目未知时，MOST方法比其他方法更有效；当活跃样本数目较少时，其效果与ORT方法相似；当差异表达的样本数目较多时，MOST方法的效果较好［103］。......
2023-11-21
-
基于机器视觉的PCB裸板缺陷检测自动化方法详细阅读
为保证质量，在PCB生产过程中必须对PCB裸板进行缺陷检测，将不合格的PCB裸板剔除出生产流水线。图10-13待检测的PCB板为了解决上述问题。其中，合格PCB检测最快；缺陷越多，检测耗时越长。为了验证系统的检测精度和稳定性，随机抽取合格的和有缺陷的PCB各200张进行检测试验。......
2023-06-28
-
浆粕浸渍性与溶解性的检测方法及修订建议优化详细阅读
目前，对Lyocell纤维用浆粕尚没有检测浸渍性能的方法和标准。而黏胶纤维浆粕反应性的检测，是对浆粕综合性能的一种评判方法，它不仅关系到其中的化学反应，而且与浆粕的物理形态有密切关系。浆粕的浸渍性能与浆粕毛细间隙的形状、纤维细胞内外表面的性质及制浆工艺有关。该法有望对浆粕浸渍性能作出较好的判断，为生产工艺的制订提供参考。......
2023-06-25
-
肌醇的检测方法详解详细阅读
肌醇广泛分布在动物和植物体内，是动物、微生物的生长因子，对降低胆固醇、促进健康毛发的生长、防止脱发有帮助。肌醇不含双键，没有特征性的紫外吸收，也没有与反相柱的相互作用力，所以不能用反相色谱与紫外检测器来测试。本方法是用离子色谱和电化学电极来测试肌醇。准确移取1 mL肌醇原始标准溶液至100 mL容量瓶中，加水定容，摇匀后即可注射。......
2023-07-02
-
汽车燃油经济性检测方法与设备详细阅读
知识点一常见油耗仪工作原理及使用汽车燃油经济性的测量方法主要有容积法、质量法、超声波法和碳平衡法等。前两种方法需要使用专用的油耗仪，现在燃油消耗量的测量主要采用容积法和质量法。称重装置的秤盘上装有油杯2，燃油经电磁阀4 加入油杯。由于它的体积较小、安装简便，VBOX 数据采集系统非常适合汽车综合测试时使用。② 能完成国家标准要求的汽车动力性、燃油经济性、操纵稳定性、制动性能等实验。......
2023-10-11
-
基于Petri网的安全性评测方法及应用详细阅读
安全性测试的目的是设法设计出一些测试用例，试图突破系统的安全保密措施。基于Petri网的安全性测试方法 基于Petri网的软件安全性测试方法主要有正向分析法和逆向分析法。这些用例构成了针对该Petri网模型的软件安全性测试用例集。参考文献[30]中将行为模式扩展为综合行为模式，并依据综合行为模式学习持续行为关系的程度，使用基于Petri网的行为理论进行云计算的安全评测。......
2023-11-18
相关推荐