PCR的模板是含有待扩增序列的DNA或从mRNA反转录的cDNA,这个技术对模板样品要求很低,甚至没有必要对待扩增的模板进行分离纯化即可直接用于反应扩增。1988年,Saiki等成功地将热稳定的Taq DNA聚合酶应用于PCR扩增,提高了反应的特异性和敏感性,是PCR技术走向实用化的一次突破性进展。一般而言,引物设计的正确与否是PCR扩增成败的关键因素。引物的设计在PCR反应中极为重要。......
2023-11-18
微生物是地球上最古老、分布最广的物种之一,其种属多样性和遗传多样性决定了其代谢多样性。与植物和动物的代谢途径相比,微生物的代谢途径虽然相对简单,但可能是最强大、最高效、与人类日常生产生活关系最密切的生物化学途径。除了参与传统的酿酒、制醋、酸乳和发酵食品生产过程,微生物或其一部分(酶)可以生产包括燃料、医药、纤维、塑料在内的几乎所有重要的工业原材料。不仅如此,微生物还能够降解毒害性化合物,修复被石油或辐射污染的场地,恢复生态。如果说工业生物技术是21世纪社会可持续发展的重要技术保障,微生物就是其灵魂所在。
早期的微生物发酵产品开发主要是筛选天然的高产菌株;而提高微生物发酵能力的研发主要集中在通过化学诱变和高效筛选技术来获得发酵能力提高的突变菌株。这些传统的菌种选育技术有着极大的局限性:微生物发酵产物种类非常有限,主要集中在乙醇、丙酮、丁醇、甘油、有机酸、氨基酸和抗生素等代谢物;另外,由于大部分微生物的发酵产物都是多种化合物的混合物,因此目标产物的产率通常比较低而下游的分离成本则非常高,这使得微生物发酵的生产成本一直居高不下。基因工程(重组DNA技术)的问世极大地推动了微生物发酵产业的发展,它使得微生物代谢途径中特定酶反应的遗传改造成为可能。然而,微生物发酵生产涉及微生物整个代谢网络中多个酶反应的协同作用。单一(或多个)酶反应的遗传改造很多时候在提高微生物发酵性能时起到的作用非常有限。
代谢工程(metabolic engineering)又称途径工程,由著名生化工程专家Bailey于1991年首先提出,他将其定义为“采用重组DNA技术,操纵细胞的酶、运输及调节功能,达到提高或改善细胞活性的目的”。同年,Stephanopoulos也在Science上论述了有关“过量生产代谢产物时的代谢工程”“代谢网络刚性、代谢流的分配、关键分叉点及速率限制步骤”等内容。随着代谢工程研究的深入,现在将其定义为利用基因工程技术,有目的地对细胞代谢途径进行精确的修饰、改造或扩展,构建新的代谢途径,以改变微生物原有代谢特性,并与微生物基因调控、代谢调控及生化工程相结合,提高目的代谢产物活性或产量或合成新的代谢产物的工程技术学科。代谢工程注重以酶学、化学计量学、分子反应动力学及现代数学的理论及技术为研究手段,在细胞水平阐明代谢途径与代谢网络之间局部与整体的关系、胞内代谢过程与胞外物质运输之间的偶联以及代谢流流向与控制的机制,并在此基础上通过工程和工艺操作达到优化细胞性能的目的。因此,代谢工程综合了基因工程、生物化学、生化工程等的最新成果,使生物学科与多门交叉学科息息相关,并被大量用于微生物发酵工业。以下将着重介绍代谢工程20多年的发展以及其如何用于提高微生物细胞发酵性能,从而推动发酵工业的进展(见图4-6)。(www.chuimin.cn)
图4-6 代谢工程发展概括图
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PCR的模板是含有待扩增序列的DNA或从mRNA反转录的cDNA,这个技术对模板样品要求很低,甚至没有必要对待扩增的模板进行分离纯化即可直接用于反应扩增。1988年,Saiki等成功地将热稳定的Taq DNA聚合酶应用于PCR扩增,提高了反应的特异性和敏感性,是PCR技术走向实用化的一次突破性进展。一般而言,引物设计的正确与否是PCR扩增成败的关键因素。引物的设计在PCR反应中极为重要。......
2023-11-18
双链DNA在一定条件下能够变性和复性,为DNA杂交技术的基础。Southern杂交能否检出杂交信号取决于很多原因,包括目的DNA在总DNA中所占的比例、探针的大小和标记效率、转移到滤膜上的DNA量及探针与靶DNA之间的同源情况等。存在于人基因组中的单拷贝序列现在能通过Southern杂交技术检测。它们主要区别在Southern杂交技术是以DNA为对象,而Northern杂交是以RNA为对象。......
2023-11-18
绝大多数反应是酶催化的,这些酶称为工具酶。因此,工具酶在基因工程技术中占有重要地位。限制性内切核酸酶能识别双短DNA中的特异性序列,通过切割双链DNA中每条链上的磷酸二酯酶而消化DNA,有人形象地将它比喻为基因工程的手术刀,是基因工程中不可缺少的工具酶。DNA样品中所含蛋白质,有机溶剂及RNA等杂质均会影响酶切反应的速度和酶切的完全程度,酶切的底物一般是双链DNA, DNA的甲基化位置会影响酶切反应。......
2023-11-18
菌种改良技术的进步是发酵工业发展的技术支撑。菌种选育改良的具体目标包括4部分。生产效率和效益总是排在一切商业发酵过程目标的首位,提高目标产物的产量是菌种改良的重要标准;②提高目标产物的纯度,减少副产物。广义上说,菌种改良可描述为采用各种技术手段处理微生物菌种,从中分离得到能显示所要求表型的变异菌种。......
2023-11-18
酸解法条件剧烈,会生成糠醛等有毒的分解产物,而且成本高,对设备有腐蚀作用,所以不宜在发酵工业上应用。生物合成法是利用微生物中的还原酶来生产木糖醇,它可有效降低木糖醇的生产成本。有研究报道了木糖醇的发酵法生产及生产中的影响因素,指出有多种微生物可产木糖醇,其中酵母最好。自然界也有一些微生物能够直接利用半纤维素进行生长,酶学分析或基因分析结果表明它们具有完善的半纤维素酶系统。......
2023-11-18
通常,柔性及半柔性节点是代谢工程设计的主要对象。在代谢工程发展初期,用于调控细胞代谢网络的策略通常分3步。图4-7早期代谢工程基本研究思路早期代谢工程用于改善工业微生物发酵的范例之一是氨基酸发酵工业。虽然代谢工程在改造某些微生物提高其发酵性能中取得了很大的成功,但是早期有相当一部分改造并没能取得预期的效果。反向代谢工程早期最成功的应用范例是利用透明颤菌血红蛋白来缓解供氧不足。......
2023-11-18
发酵液提取的目的是除去与目标产物性质有很大差异的杂质,这一步可以使产物浓缩,并明显的提高产品质量。被吸附的流体称为吸附质,多孔的固体物质称为吸附剂。采用膜分离技术对酶制剂进行精制、浓缩,可使产品的纯度较传统的方法提高4~5倍,酶回收提高2~3倍,高污染液产出量减少到原来的1/3~1/4。......
2023-11-18
将这些系统生物学技术和传统代谢工程以及下游发酵工艺优化相互结合,科学家们进一步提出了系统代谢工程的概念。合成生物学和传统的代谢工程用于微生物发酵生产时,目的是一样的,区别在于所使用的方法。......
2023-11-18
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