CANOCO排序方法-生态数据分析

2023-11-17 理论教育版权反馈

【摘要】：3．一个数据集被另一个数据集解释后，再被第三个数据解释——偏典范排序。图16-1CANOCO分析数据的一般流程1．排序模型的决定。表16-1基本排序方法和排序模型对照表3．CanoDraw作图。

一、排序方法

CANOCO中的排序方法有四种：

1．描述单个数据集结构的方法——排序/间接梯度分析。例如描述一个生物群落的结构或者环境变量间的相关结构。

2．用一个数据集解释另一个数据集——典范排序/直接梯度分析。例如使用环境数据解释或预测物种的多度。

3．一个数据集被另一个数据集解释后，再被第三个数据解释——偏典范排序。例如季节效应被校正后，使用环境数据解释或预测物种多度。

4．描述一个被一个数据集解释后的数据集结构——偏排序。例如描述季节效应校正后的群落结构。

二、排序分析流程

利用CANOCO分析多元数据的一般流程如图16-1所示，图中前两步在上一章节中已经介绍，这里主要以后面三步主要内容进行介绍。

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图16-1　CANOCO分析数据的一般流程

1．排序模型的决定。

在Canoco for Windows的分析过程中，按照操作步骤会出现一个关于模型的选择窗口，如图2-3所示，究竟是选择线性模型还是单峰模型这里有一个比较简单的判断方法：先对物种数据进行DCA分析，分析完成后在“Log View”窗口中，各特征值分布部分找到“Lengths of gradient”信息，这一信息代表的是每个排序轴的梯度长度。如果四个轴中梯度最大值超过4，选择单峰模型比较合适；如果小于3，线性模型比较合适；介于3-4之间，两种模型均适合。(www.chuimin.cn)

注意：物种数据的量纲不同时不适合做单峰模型排序，即便梯度长度大于4；有空样方出现的数据不能顺利进行单峰排序分析，非要釆用单峰分析，需要把空样方剔除。

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图16-2　分析模型选择窗口

2．具体排序方法的选择。

排序模型确定后需要考虑的是选择何种排序方法，为了选择更合适的排序方法，你尽可能将各种方法都尝试，选择一个你最想要的分析结果和排序图。各种排序方法的具体的特征和操作方法将在接下来的章节详细介绍，基本的排序方法和排序模型对照表如表16-1所示。

表16-1　基本排序方法和排序模型对照表

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3．CanoDraw作图。

在介绍如何使用CanoDraw作图之前，必须考虑以下两点：

明确环境因子里面是否有定性变量，这些变量必须预先选出来，然后才能用于生成排序图，预选方法：Project＞Nominalvariab。

对于分量很小，与排序图的解释没有多少参考价值的稀有种，可以将这些物种不在排序图中展示出来。一般可以通过两个标准来选择保留的物种：物种适合度（species fit）和物种的权重（species weight）。前者表示每个物种变化被排序空间所能展示的百分比；后者等于某物种在所在样方内多度之和与所有物种多度之和的比，且仅仅在单峰排序里面有应用价值，可自行设置权重值，只有高于该值的物种才能纳入排序图。

CANOCO排序方法-生态数据分析

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