CANOCO软件简介

2023-11-17 理论教育版权反馈

【摘要】：使用CANOCO进行排序，能够揭示：生物群落结构；植物与动物群落以及它们与环境之间的联系。CANOCO带有比较全面的排序方法。WcanoImp：将以电子表格形式保存的外部数据转化为CANOCO识别的形式。

一、软件功能

CANOCO软件是生态学应用软件中用于约束与非约束排序的最流行工具，它整合了排序以及回归和排列方法，以便得到更完整的生态数据统计模型。使用CANOCO进行排序，能够揭示：生物群落结构；植物与动物群落以及它们与环境之间的联系。

二、软件模块

CANOCO软件包主要包含以下几个模块：

1．CANOCO for Windows：软件包的核心，用来指定要分析的数据和排序模型，排序方法以及分析结果的查看等基本操作命令均被集中在该模块的对话框中。

CANOCO带有比较全面的排序方法。核心部分是基于线性模型的PCA和RDA，基于单峰的模型的CA，DCA和CCA。在这些基本排序方法基础上，CANOCO也可以做CVA（典范变量分析），PCoA（主坐标分析）。

进入软件后的界面，和Excel一样有快捷工具栏，鼠标做短暂停留会有英文提示出现，不再赘述。左侧的Project View窗口是数据指定，分类类型选择等一系列功能设置的引导窗口，按步骤操作即可；右边Log View窗口用来记录分析过程和部分统计结果（如四个排序轴统计结果、轴与环境因子的相关性、蒙特卡罗检验结果等），其他一些分析结果（如物种、环境因子及样方坐标等）均保存在相应的∗．sol文件中，该文件可以用记事本打开。(www.chuimin.cn)

WcanoImp：将以电子表格形式（Excel等）保存的外部数据转化为CANOCO识别的形式。

该模块在核心模块中没有快捷激活命令，必须依常规方式打开。进入后界面上边是关于如何使用该模块的简短说明，下面部分是可选框。一般情况下在Excel中组织原数据时，以行代表样方，以列代表变量，这时第一个选择框就不需选择；Excel中组织数据时如果没有将第一行第一列作为样方名行和变量名列，则需要选择第二和第三选择框，这样该模块会自动为导入的数据添加样方名和变量名；设置完成后点击保存按钮，在弹出的对话框中命名并选择存放位置，即可将剪贴板中的数据文件（从Excel中复制的）转化为CANOCO能识别的类型（∗．dta）。

样方名和变量名命名规则：字符不得超过8个，字符类型可以为数字、字母、点、连接符和空格；超过8位的，在导入数据时Wcanolmp会默认的只保留前八位，并且以点取代不符合规定的字符。

2．CanoDraw 4．5 for Windows：用来绘制各种类型的排序图，同时也可以生成多种等值线和回归模型图，并进一步深层次发掘排序结果。该模块可以直接从主程序界面工具栏激活。

3．CanoMerge：合并Canoco识别的dta类型数据文件，并可以将数据文件以带制表分隔符的文本形式输出（基本常用统计软件均兼容该类型文件），同时该模块具有滤掉低频率物种的功能。

4．PrCoord：对特定数据集进行主坐标分析以及冗余分析。

CANOCO软件简介

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