也可以用图16-6的形象方法解读,将变量B反向延长,物种1和物种分别投影于其上,可以很清楚地看出物种2的投影与B同向,代表正相关;同理,物种1为负相关。图16-12基于RDA双序图上分析物种沿海拔梯度分布情况2.基于单峰模型排序图的解读。......
2023-11-17
一、梯度分析
群落学物种组成数据的分析方法通常有两种:梯度分析(排序)和分类方法(聚类、TWINSPAN等)。这里的梯度分析是广义的梯度分析,泛指任何以揭示物种组成数据与实测或潜在的环境因子之间关系的方法。
二、为什么排序
当考察植物或动物群落沿着一系列环境条件下的变化情况时,我们经常发现在不同条件的群落不仅物种组成变化很大,而且这些变化往往具有连续性和可预测性。
通过排序分析,既可以认识群落格局,也可以将排序轴跟我们已知的环境条件联系起来,看是否代表某一环境梯度。另外,还必须用统计手段来检验排序轴到底是否真能代表环境因子的梯度。
三、专业术语
生态学原始数据一般由两个部分构成,一组是响应变量(response variable),另外一组是解释变量(explanatory variables)。
1.解释变量:相当于自变量,又称预测变量,经常分为主环境变量和协环境变量。
2.响应变量:相当于因变量,又称物种数据。
3.梯度分析:即通常所说的排序分析,是揭示物种组成数据与实测或潜在环境因子之间关系的方法的总称。包括约束性排序和非约束性排序。
4.约束性排序(直接排序):在特定的梯度上(环境轴)上探讨物种的变化情况。例如:RDA,CCA,DCCA等。
5.非约束性排序(间接排序):寻求潜在的或在间接的环境梯度来解释物种数据的变化。
6.偏分析:预先剔除物种变化中由协变量产生的效应,再通过排序揭示剩下物种变化的排序方法。
7.混合排序分析:前面若干轴采用约束排序,而剩下的轴是非约束性排序的梯度分析方法。
8.非约束性排序方法。
主成分分析(Principal components analysis,PCA)
对应分析(Correspondence analysis,CA)(www.chuimin.cn)
去趋势对应分析(Detrended Correspondence analysis,DCA)
主坐标分析(Principal coordinates analysis,PCO)
9.约束性排序。
冗余分析(Redundancy analysis,RDA)
典范对应分析(Canonical Correspondence analysis,CCA)
去趋势典范对应分析(Detrended Canonical Correspondence analysis,DCCA)
典型变量分析(Canonical variate analysis,CVA,db-RDA)
10.物种响应环境梯度模型。
物种响应环境梯度模型如图16-1。
线性响应模型经常可以通过传统的方法(最小二乘法)回归拟合。
图16-1 物种响应环境梯度模型
但对于单峰响应模型,估计物种在环境梯度上最适值最简单的方法就是通过基于所有包含该物种的n个样方中环境因子值的加权平均得到。具体算法如下:
上式中,Envi是第i个样方的环境因子值,Abundi是物种在i样方的多度。
有关生态数据分析与建模的文章
也可以用图16-6的形象方法解读,将变量B反向延长,物种1和物种分别投影于其上,可以很清楚地看出物种2的投影与B同向,代表正相关;同理,物种1为负相关。图16-12基于RDA双序图上分析物种沿海拔梯度分布情况2.基于单峰模型排序图的解读。......
2023-11-17
3.一个数据集被另一个数据集解释后,再被第三个数据解释——偏典范排序。图16-1CANOCO分析数据的一般流程1.排序模型的决定。表16-1基本排序方法和排序模型对照表3.CanoDraw作图。......
2023-11-17
土壤无论对植物来说还是对土壤动物来说都是重要的生态因子。由于在土壤中运动要比大气中和水中困难得多,所以除了少数动物能在土壤中掘穴居住外,大多数土壤动物都只能利用枯枝落叶层中的孔隙和土壤颗粒间的空隙作为自己的生存空间。因此,土壤数据包括野外调查数据,比如枯枝落叶层的厚度、土壤类型、土壤厚度和剖面特征、土壤温度等。室内测定数据包括土壤结构、土壤容重、土壤水分、土壤物理特性及化学特性。......
2023-11-17
灵敏度分析试图测量模型的一些参数、强制函数、状态变量初始值,或子模型对最重要状态变量的灵敏度。因此,对于参数P的灵敏度定义如下:S=[x/x]/[P/P]式中:x代表所考虑的状态变量。通常需要在两个或多个水平上发现参数变化的灵敏度,因为参数和状态变量之间的关系很少是线性的。如果发现所观察的状态变量对某个子模型很灵敏,应该考虑哪几个别的子模型可以替换使用,这些子模型应在野外或实验室做进一步的具体检验。......
2023-11-17
为了消除量纲影响和变量自身变异大小和数值大小的影响,故将数据标准化。经过标准差标准化后,数据都是没有单位的纯数量。尽管如此,它还是当前用得最多的数据标准化方法,也是SPSS中最为常用的标准化方法。即第三步,再对变量进行标准差标准化,即将某变量中的观察值减去该变量的平均数,然后除以该变量的标准差。表13-7长江17个观测点的水质分析表数据转换步骤如下:1.数据的标准化处理。......
2023-11-17
直线回归是回归分析中最简单的一种,又称为简单回归。(一)直线回归方程散点图上呈现直线趋势的两个变数,自变量x的每一个取值都有y的一个分布与之对应。试计算其直线回归方程。为简化手续,可从以下恒等式得出:(五)直线回归的数学模型和基本假定回归分析的依据是直线回归模型。......
2023-11-17
试验结果只能是“非此即彼”构成对立事件,将这种事件构成的总体称为二项总体,其概率分布称为二项分布。显然,二项分布是一种离散型随机变量的概率分布。此外,还有不少随机变量的概率分布在一定条件下以正态分布为其极限分布。关于正态分布的概率计算,我们先从标准正态分布着手。......
2023-11-17
表15-2数据视图中各类型的设定3.进行单因素方差分析。图15-6数据统计分析结果输出4.接下来再看方差齐性检验的结果。来自正态总体的两个样本进行均值比较常使用T检验的方法。同样是数据输入完成后,依次点击“分析—比较均值—独立样本T检验”。......
2023-11-17
相关推荐