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呼吸道微生物群在出生后7周内成熟

【摘要】:3个MPs均在出生后3天内检测到。然而,出生后7周以上的婴儿中,未发现解脲原体(n=7)和葡萄球菌MPs,而在出生年内的婴儿所有样本中均能检测到混合MP。图8-1-1新生儿下呼吸道微生物群分为3个不同的微生物群,并在出生后7周内成熟注:A.Bray-Curtis距离的PCoA评分图,用虚线将样本连接到聚类中心。颜色表示微生物群概况,由总队列中PAM聚类确定。C.比较MP多样性的盒状图,由香农指数测量。垂直灰线表示估计为7.01周的临界点。

3个MPs均在出生后3天内检测到(图8-1-1E)。然而,出生后7周以上的婴儿中,未发现解脲原体(n=7)和葡萄球菌(n=21)MPs,而在出生年内的婴儿所有样本中均能检测到混合MP(卡方=14.3,**P<0.001)。香农指数与出生后年龄呈矩形双曲线关系,因此使用双参数Michaelis-Menten方程来模拟总队列中细菌多样性随年龄的变化的情况(n=45)(参数估计t=7.33和2.07,***P<0.001和*P<0.05分别针对每个参数)(图8-1-1A)。通过评估方差的均匀性和残差的正态性来检验模型假设(图8-1-1B),估计了多样性建立的断点(这里定义为从一种功能关系到另一种功能关系的转换)。断点为出生后7周(1.76个月),之后多样性达到稳定的替代状态(图8-1-1F)。

图8-1-1 新生儿下呼吸道微生物群分为3个不同的微生物群,并在出生后7周内成熟(www.chuimin.cn)

注:A.Bray-Curtis距离的PCoA评分图,用虚线将样本连接到聚类中心。颜色表示微生物群概况(MP),由总队列中PAM聚类确定(n=45)。B.各MPs中最丰富属(平均相对丰度>0.5%)的热图及相应的Ward聚类树图。C.比较MP多样性的盒状图,由香农指数测量。D.盒状图比较MP中细菌负荷。E.生命第一年样本的累积分布,按MP进行分层。F.采用michael-menten(MM)方程模型建立总队列(n=45)中年龄相关多样性(Shannon指数)。红线表示将实验数据拟合成 90%置信区间的参数模型得到的模拟曲线。垂直灰线表示估计为7.01(1.76个月)周的临界点