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预测孕产妇IBD对婴儿肠道菌群多样性的影响

【摘要】:图6-2-3孕产妇IBD状况预测婴儿肠道菌群多样性与分类对实验数据进行分析的过程中,79例婴儿已经出生,其随后的3个月里进行了306份高质量粪便样品的收集用以分析。总体而言,婴儿粪便样本中细菌多样性随着时间推移而有所变化。在顺产和剖宫产婴儿中进行分层分析,发现孕产妇IBD诊断依旧是预测微生物组多样性的重要因子。发现产孕妇IBD诊断和专一的喂养方式与Bifidobacterium属相对丰度的降低密切相关。

图6-2-3 孕产妇IBD状况预测婴儿肠道菌群多样性与分类(www.chuimin.cn)

对实验数据进行分析的过程中,79例婴儿已经出生,其随后的3个月里进行了306份高质量粪便样品的收集用以分析。总体而言,婴儿粪便样本中细菌多样性随着时间推移而有所变化。IBD孕产妇所产婴儿的肠道微生物组,相比于对照组孕产妇所产婴儿,呈菌群的低水平多样性和变异(图6-2-3)。具体来看,基于IBD 状况下,在第7天、14天和90天处α–多样性具有显著差异(Wilcoxonp=0.05、0.03、0.02;图6-2-3A)。此外,孕产妇IBD诊断结果是一个预测婴幼儿β–多样性的重要因子(图6-2-3B)[每个时间点的单变量和多变量PERMANOVA(P<0.05)],此外,分娩方式、抗生素使用喂养方式以及早产也与不同时间点的整体菌群丰度密切相关。在顺产和剖宫产婴儿中进行分层分析,发现孕产妇IBD诊断依旧是预测微生物组多样性的重要因子(排除了分娩方式)。同样的,排除了只有奶粉喂养的婴幼儿粪便样本后,这种差异依然存在。随后,采用LEfSe分析所有时间点下的分娩方式,该方式也是一种预测生命早期微生物组特性的主要因子。发现,IBD孕产妇所产婴儿表现出Gamma proteobacteria类细菌的高度富集,而Bifidobacterium属有所下降(相比对照组)(图6-2-3C),而这一趋势一直持续了3个月(图6-2-3D/E)。随后,测试了随着时间推移,不同暴露方式对于不同种属相对丰度的影响。发现产孕妇IBD诊断和专一的喂养方式与Bifidobacterium属相对丰度的降低密切相关(对数尺度分别下降1.4倍,P=0.007;下降1.7倍,P=0.048)。调整协变量之后,产孕妇IBD状况成了头三个月唯一预测引发结肠炎的 Gammaproteobacteria类群相对丰度变化的重要因子(P=0.002)。