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2023-12-04
在属水平上,研究者从86份粪便样本中鉴定出了604个属。其中,以Bacteroides属(39.91±2.01%)为主,其次为Prevotella(6.19±1.36%)、Faecalibacterium(4.83±0.50%)、Ruminococcus(4.07±0.52%)、Parabacteroides(3.79±0.43%)、Fusobacterium(3.58±0.70%)、Escherichia(2.34±0.43%)、Roseburia(2.08±0.26%)、Streptococcus(1.84±0.41%)和Blautia(1.76±0.19%),前10个属占分析得到的序列的71.75±1.63%(图5-6-2A)。基于非参数Kruskal–Wallis秩和检验,在不同的原发性肝癌患者分期组和健康对照组中,总计有54个属存在显著差异。与健康对照组相比I期原发性肝癌患者中Actinomyces、Atopobium、Desulfococcus、Enterobacter、Paraprevotella、Planctomycetes、Prevotella、Veillonella的丰度升高;Desulfococcus、Enterobacter、Lactococcus、Leptotrichia、Paraprevotella、Planctomycetes、Prevotella、Veillonella属在II期原发性肝癌患者中丰度升高;Actinomyces、Atopobium、Desulfococcus、Enterobacter、Haemophilus、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Oribacterium、Prevotella、Rothia、Selenomonas、Veillonella属在III期原发性肝癌患者中丰度升高(图5-6-2A)。
图5-6-2 根据粪便菌群中发现的排名前10的菌属
注:A.不同原发性肝癌患者和健康对照组肠道菌群中发现的显著差异菌属绘制的Circular Layout。B.进化分枝图布局。与健康对照组相比,图中圆形的颜色显示了原发性肝癌不同阶段患者肠道菌群在属水平的变化。丰度升高的属包括黄色(Ⅰ期)、灰色(Ⅱ期)、淡红色(Ⅲ期)、粉红色(Ⅰ期和Ⅱ期)、红色(Ⅰ期和Ⅲ期)、暗红色(Ⅱ期和Ⅲ期)和黑色(Ⅰ期、Ⅱ期和Ⅲ期);丰度降低的属包括鲜绿色(第Ⅰ期)、绿色(第Ⅱ期)、蓝色(第Ⅲ期)、浅绿色(第Ⅰ期和第Ⅱ期)、浅蓝(第Ⅰ期和第Ⅲ期)、深蓝(第Ⅱ期和第Ⅲ期)、深绿色(第Ⅰ期、第Ⅱ期和第Ⅲ期)。
发现不同阶段原发性肝癌与健康对照组中,厚壁菌门与拟杆菌门(图5-6-3A)、土著菌与非土著菌的丰度比值(图5-6-3B)、肠杆菌科双歧杆菌属(图5-6-3C)无显著性差异。但该分析方法并不全面,因此本研究建立了一个更为综合的指标,称为菌群失调程度(Ddys),比较分析原发性肝癌各阶段及健康对照组肠道微生物群的Ddys指数差异。在用于计算Ddys的20个常见肠道细菌属中,本研究未发现一种主要的益生菌属(Oscillibacter)和两种潜在的有害菌属(Akkermansia、Helicobacter)。与健康对照组相比,原发性肝癌患者的Ddys明显增加。此外,研究者发现,随着原发性肝癌的进展,Ddys指数有增加的趋势,但不同原发性肝癌分期的患者间差异不显著(图5-6-3D)。(www.chuimin.cn)
图5-6-3 箱形图显示了菌群失调程度的变化
注:A.指标的描述以及如何根据厚壁菌门和拟杆菌门的相对丰度计算这些指标。B.根据土著菌和非土著菌群的相对丰度。C.基于双歧杆菌和肠杆菌科的相对丰度。D.根据7个益生菌属(Anaerostipes、Bifidobacterium、Coprococcus、Faecalibacterium、Lactobacillus、Oscillibacter、Phascolarctobacterium)以及13个有害菌属(Akkermansia、Bacteroides、Clostridium、Dorea、Escherichia、Fusobacterium、Haemophilus、Helicobacter、Klebsiella、Prevotella、Ruminococcus、Streptococcus、Veillonella)。
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