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酵母RNA的提取、鉴定和测量方法

【摘要】:RN A在强酸和高温条件下可被降解为核糖、嘌呤碱、嘧啶碱和磷酸等组分。在RN A的含量测定中,采用紫外吸收的方法测定所提取的RN A的含量,同时分别于260nm和280nm处测出A值,可以鉴定RNA的纯度。称量所得RNA粗品质量。取水解液进行下列组分的鉴定。同时测定280nm波长处吸光值,计算A260与A280比值,鉴定所提取酵母RNA的纯度。

【目的要求】

1.学习稀碱法提取RN A的原理和操作方法。

2.了解核酸的组成,并掌握鉴定核酸组分的方法。

3.学习地衣酚显色法及紫外分光光度法测定RN A含量的原理及方法。

【实验原理】

酵母中RNA含量较高,占菌体质量的2.67%~10.0%,而干扰物质DNA的含量较少,仅占菌体质量的0.03%~0.516%,因此酵母是提取RNA较为理想的材料。

RN A可溶于稀碱溶液。在碱性提取液中,利用加热煮沸的方法使蛋白质变性,通过离心技术除去蛋白质。RNA溶液其pI较低,为2.0~2.5,利用RNA在乙醇溶解度低的性质,加入酸性乙醇使RN A从溶液中沉淀出来,由此即可得到RN A的粗制品。

RN A在强酸和高温条件下可被降解为核糖、嘌呤碱、嘧啶碱和磷酸等组分。用硝酸银、地衣酚(3,5-二羟基甲苯)和定磷试剂可分别鉴定RN A水解液中嘌呤碱、核糖和磷酸等组分的存在。

定糖法:RN A分子中的核糖和浓盐酸(浓硫酸)作用脱水生成糠醛,糠醛与酚类化合物(地衣酚)在Fe3+或Cu2+催化下,缩合而生成鲜绿色复合物。

定磷法:强酸将核酸样品消化,使核酸分子中的有机磷转变为无机磷,无机磷与钼酸反应生成磷钼酸,磷钼酸在还原剂(抗坏血酸)作用下还原成钼蓝。

嘌呤的鉴定:嘌呤与硝酸银作用生成白色的嘌呤银沉淀。

在RN A的含量测定中,采用紫外吸收的方法测定所提取的RN A的含量,同时分别于260nm和280nm处测出A值,可以鉴定RNA的纯度。

【试剂与器材】

1.试剂、材料

(1)0.04mol/L NaOH溶液。

(2)95%乙醇。

(3)酵母粉。

(4)1.5mol/L H2SO4溶液。

(5)5%氨水

(6)0.1mol/L AgNO3溶液。

(7)酸性乙醇溶液 10mL浓盐酸加到1000mL乙醇中混匀。

(8)FeCl3浓盐酸溶液 1mL10% FeCl3加到200mL浓盐酸中混匀。

(9)地衣酚(3,5-二羟基甲苯)—乙醇溶液 将6g地衣酚溶于100mL95%乙醇中,冰箱中保存。

(10)定磷试剂 A.17%H2SO4:将17mL浓硫酸缓缓加入83mL水中;

B.2.5%钼酸铵溶液:2.5g钼酸铵溶于100mL水中;

C.10%抗坏血酸溶液:10g维生素C溶于100mL蒸馏水中,用棕色瓶贮存。

临用时将三种溶液和水按下列比例混合:17%H2SO4∶2.5%钼酸铵∶10%抗坏血酸∶水=1∶1∶1∶2(体积比)。

2.器材

电子天平;紫外分光光度计;量筒(100mL);布氏漏斗;低速离心机;吸量管(1mL);三角瓶(250mL);电磁炉不锈钢锅。(www.chuimin.cn)

【操作方法】

1.酵母RN A提取

(1)称4g干酵母粉置于100mL三角烧瓶中,加入0.04mol/L NaOH溶液30mL,在沸水浴中加热30min,期间不时搅拌。

(2)冷却后转入离心管中,3500r/min离心10min。将上清液缓缓倾入20mL酸性乙醇溶液中,边加边搅动。加毕,静置,待RNA沉淀完全后,3500r/min离心5min。弃去上清液。

(3)用95%乙醇洗涤沉淀,3500r/min离心5min。弃去上清液,再用10mL95%乙醇洗涤沉淀,离心(同上)5min,即得RNA粗制品。用无水乙醇将沉淀悬浮,3500r/min离心5min,沉淀在空气中干燥。称量所得RNA粗品质量。

代入公式计算含量:

2.酵母RNA组分的定性鉴定

利用离心管中残留的RNA进行定性鉴定。加1.5mol/L H2SO45mL,在沸水浴中加热10min使RNA水解,用流水冲洗管外冷却。取水解液进行下列组分的鉴定。

(1)嘌呤碱的鉴定 取2支试管,编号,按表3-12操作。观察有无嘌呤碱的银化合物沉淀产生。静置15min后,再比较两管中的沉淀。

表3-12 嘌呤碱的鉴定

注:可用pH试纸检测加氨水后呈碱性的情况。

(2)核糖的鉴定 取2支试管,编号,按表3-13加入试剂。摇匀后于沸水浴中加热5min,观察两管颜色的变化。

表3-13 核糖的鉴定

(3)磷的鉴定 取试管2支,编号,按表3-14加入试剂。摇匀后于沸水浴中加热,观察两管颜色的变化。

表3-14 磷的鉴定

3.紫外吸收法测定RN A含量及纯度

准确称取RNA样品50mg,加少量0.01mol/L NaOH溶液调成糊状。加适量水,用5%氨水调至pH7.0,然后加水定容至50mL。取0.5mL,用水稀释至10mL。于紫外分光光度计260nm波长处测定吸光值,根据下列公式计算RNA含量。

式中 A260——260nm波长处吸光值;

L——比色杯的厚度,1c m;

0.024——每毫升溶液内含1μg RNA的A260值;

50——样品浓度,μg/mL。

同时测定280nm波长处吸光值,计算A260A280比值,鉴定所提取酵母RNA的纯度。

【要点提示】

1.如果待测样品中含有酸溶性核苷酸或可透析的低聚多核苷酸,需对样品进行处理后再测定其RN A含量。

2.RNA的260nm与280nm吸光度的比值在2.0以上,DNA的260nm与280nm吸光度的比值在1.8左右,当样品中蛋白质含量较高时,比值下降。

【思考题】

1.为什么用稀碱溶液可以使酵母细胞裂解?

2.RNA提取过程中的关键步骤及注意事项有哪些?