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核酸含量测定-紫外吸收法-生物化学实验指导

【摘要】:核酸及其衍生物核苷酸、核苷、嘌呤和嘧啶具有吸收紫外光的性质,其吸收高峰在260nm波长处。因此,测定未知浓度核酸溶液的A260值,即可计算出其中RNA或DNA的含量。通常蛋白质的最大吸收峰在280nm波长处,在260nm处的吸收值仅为核酸的1/10或更低,因此对于含有微量蛋白质的核酸样品,测定误差较小。选择厚度为1cm的石英比色杯,于紫外分光光度计上260nm波长处测定A值。

【目的要求】

1.学习和掌握应用紫外分光光度法直接测定核酸含量的原理及技术。

2.进一步熟悉紫外分光光度计的使用方法。

【实验原理】

核酸及其衍生物核苷酸、核苷、嘌呤和嘧啶具有吸收紫外光的性质,其吸收高峰在260nm波长处。核酸的摩尔消光系数(或称吸收系数)用ε(P)来表示,即每升含有1mol核酸磷的溶液在260nm波长处的吸光度(即A260值)。RNA溶液(pH7.0)的ε(P)为7700~7800。RNA的含磷量约为9.5%,含1μg/mL RNA溶液的A260为0.022~0.024。小牛胸腺DNA钠盐溶液的ε(P)(pH7.0)为6600,DNA含磷量为9.2%,含1μg/mL DNA钠盐溶液的A260为0.020。通常规定:在260nm波长下,浓度为1μg/mL的DNA溶液其吸光度为0.020,而浓度为1μg/mL的RNA溶液其吸光度为0.024。因此,测定未知浓度核酸溶液的A260值,即可计算出其中RNA或DNA的含量。

蛋白质和核苷酸也能吸收紫外光。通常蛋白质的最大吸收峰在280nm波长处,在260nm处的吸收值仅为核酸的1/10或更低,因此对于含有微量蛋白质的核酸样品,测定误差较小。RNA的260nm与280nm吸收的比值在2.0以上;DNA的260nm与280nm吸收的比值则在1.8左右,当样品中蛋白质含量较高时,比值下降。

试剂与器材】

1.试剂

(1)钼酸铵-过氯酸沉淀剂 取3.6mL70%过氯酸和0.25g钼酸铵溶于96.4mL蒸馏水中,即成0.25%钼酸铵-2.5%过氯酸溶液。

(2)5%~6%氨水 用25%~30%氨水稀释5倍。

(3)测试样品RNA或DNA干粉。

2.器材

紫外分光光度计;电子天平;低速离心机;吸量管(0.5mL,2mL);试管及试管架;滤纸;擦镜纸;容量瓶(50mL);冰袋(冰浴)。

【操作方法】

1.准确称取RNA或DNA样品0.50g,加少量0.01mol/L NaOH溶液调成糊状,再加适量水,用5%氨水调至pH7.0,然后加水定容至50mL。选择厚度为1cm的石英比色杯,于紫外分光光度计上260nm波长处测定A值。(www.chuimin.cn)

式中 A260——260nm波长处吸光值;

n——稀释倍数;

L——比色杯的厚度,1c m;

0.024——每毫升溶液内含1μg RNA的A260值;

0.020——每毫升溶液内含1μg DNA钠盐的A260值。

2.如果待测的核酸样品中含有酸溶性核苷酸或可透析的低聚多核苷酸,在测定时需加钼酸铵-过氯酸沉淀剂,沉淀除去大分子核酸,测定上清液260nm波长处A值作为对照。具体操作如下:

取2支离心管,甲管加入2mL样品溶液和2mL蒸馏水,乙管加入2mL样品溶液和2mL沉淀剂。混匀,在冰浴中放置30min,以3000r/min离心10min。从甲、乙两管中分别吸取0.5mL上清液,用蒸馏水定容至50mL。选择厚度为1cm的石英比色杯,在260nm波长处测定A值。

【要点提示】

1.紫外分光光度计使用前要预热。

2.比色皿应成套使用,注意保护,不能拿在光面上。

3.离心机使用前必须将离心管平衡、对称放置。调速必须从低到高,离心结束等转子完全停下后,再打开盖子,然后将转速打到最低。

【思考题】

1.用该法测定样品的核酸含量,有何优点及缺点?

2.若样品中含有蛋白质,如何排除干扰?你认为最简便的方法是什么?