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基因表达:信息编码转化为生命活动

【摘要】:核酸以自身的DNA链条对生命活动进行信息编码,而形形色色的蛋白质分子是生命活动的具体执行者。这种关系体现在核酸与蛋白质这两种生物大分子的主导作用,两者相互依存,通过信息编码、信息转换、信息表达、物理化学反应,实现生命活动的全部内容。研究生命现象,核心问题是研究核酸与蛋白质及其相互关系。

通过以上的叙述,我们对生物细胞的灵魂与计算机的灵魂,即它们各自的信息运行、存储和控制系统进行了对比。接下来,让我们比较一下它们的工作方式

无论是计算机还是生物细胞,它们的工作或生命活动都沿着以下轨迹运行:在信息编码控制之下,从外界获取能量(物质)和信息,对能量(物质)和信息进行加工、改造、转化,生成一系列产品,所生成的产品用于自身更新、信息传递或输出外界。

计算机在进行每一项工作时,首先要输入任务指令,激活特定的程序,在程序控制下对信息进行运算、翻译、加工,形成并输出产品(数据、文字、图像、色彩、声音等)。计算机只能处理由0和1组成的“二进制数码串,所有输入的信息必须翻译成数码,才能进行运算;运算的结果要翻译成我们所需要的产品才能输出。因此,计算机的全部程序都以数码串的形式存储和运行。“翻译”的过程,就是依照事先编写的“密码本”,把输入的信息翻译成密码,进行运算;运算的结果又依照“密码本”翻译成产品。这与电报通信非常相似:发电报,首先要把文字翻译成电报密码,通过有线或无线电波发送出去,在终端再次翻译成文字形式。

我们花这么多笔墨描写计算机的工作方式,是为了更直观的理解生物细胞的工作方式。细胞的信息编码是DNA链条,由A、G、C、T四种核苷酸分子排列组合而成,其中隐藏着无数的密码,构成大约2.5万个基因。2.5万个基因就好比计算机的2.5万个程序。当细胞收到任务指令(指令可来自细胞外或细胞内),首先是基因表达,相当于激活程序、运转程序。我们已经知道,细胞内隐藏的大约2.5万个基因平时处于待命状态,有序的存放在23对染色体上,就像计算机的程序存放在C盘上一样。当接到任务时,相应的基因被激活,开始工作,这叫作基因表达。基因表达分为两个步骤,第一步是转录,第二步是翻译。转录就是构成这个基因的DNA数码链条从染色体上展开,以自己为模板制作一份拷贝,这份拷贝叫作信息核糖核酸(mRNA)。mRNA所携带的密码与基因中的DNA密码完全相同,所不同的是DNA中的T(胸腺嘧啶)被mRNA中的U(尿嘧啶)所取代。为什么要转录一份拷贝呢?因为基因密码保存在细胞核中的染色体上,而基因表达的场所一般是在细胞质中。基因要永久保存、反复表达,每次执行任务不能亲自上前线,而是派一位“信使”,携带着基因密码进入细胞质去执行翻译工作,这位信使就是mRNA。

话说mRNA被复制出来以后,经过梳妆打扮(分子生物学术语叫作剪接、戴帽、加尾),使之具备很强的稳定性和战斗力,携带着基因密码奔赴前线(细胞质)。去干什么呢?去指导蛋白质的合成,这个过程叫作翻译。

我们知道,核酸与蛋白质这两种生物大分子是一切生命活动的基础。核酸以自身的DNA链条对生命活动进行信息编码,而形形色色的蛋白质分子是生命活动的具体执行者。构成蛋白质分子的基本单位是氨基酸。氨基酸共计有20种,按不同的种类和顺序排列成肽链,肽链进一步按一定的空间结构组合成蛋白质。细胞的自身建设与维护,细胞生产的各种酶、激素及活性物质,细胞的化学反应催化功能,细胞的运动,细胞的生物电活动,细胞与细胞之间的信息联络及物质交换等,所有这些生命活动都是由蛋白质去执行的。基因表达的结果正是精确地合成具备特定功能的蛋白质,让它们去执行特定的功能。(www.chuimin.cn)

生命真的太神奇了,基因的信息编码与构成蛋白质的氨基酸之间竟然存在着固定的联系,两者可以互相翻译!分子生物学家早在20世纪60年代就破译了DNA三连密码与氨基酸之间的对应关系,这就是“遗传密码词典”。上文已经阐述过,在DNA链条上每3个相邻的碱基序列组成一个三连密码,合计有43=64个密码。其中61个密码分别为20种氨基酸编码,如CUC对应亮氨酸,ACG对应苏氨酸,AGA对应精氨酸等。剩余的3个密码是翻译过程的终止信号。一个mRNA分子携带的全部密码,正好对应于一个特定蛋白质分子的氨基酸及其排列顺序。

充当信使的mRNA进入细胞质,在那里召集氨基酸,以自己为模板,依照三连密码与氨基酸的对应关系,使氨基酸排列为肽链,进一步构成特定的蛋白质,完成基因表达的翻译过程。

当然,转录和翻译过程还有许多细节,如果读者有兴趣,可以阅读分子生物学专业书。我们在这里要重点理解基因信息编码与生命活动之间的关系。这种关系体现在核酸与蛋白质这两种生物大分子的主导作用,两者相互依存,通过信息编码、信息转换、信息表达、物理化学反应,实现生命活动的全部内容。

研究生命现象,核心问题是研究核酸与蛋白质及其相互关系。人类进入21世纪,生命科学进入分子生物学时代,医学也随之向“精准医学”迈进。精准医学的核心,就是要搞清楚几万个基因和几万种蛋白质,搞清楚它们的功能、变异、相互关系以及与生命活动和疾病的内在联系,并找到精准的干预手段。讨论医学原理,不能绕开核酸与蛋白质这个核心问题。于是我们找一个捷径,借助计算机编码与翻译的工作方式,来类比生物细胞的基因和基因表达。

以上的叙述,仅仅从单个细胞的角度去理解基因表达。对于多细胞生物特别是人体来说,涉及基因表达的问题就太多了。无数不同类型的细胞构建成组织、器官、系统,形成统一的有机体。每个细胞都存储着一整套基因,绝不能各行其是、随意表达,而是服从整体生命活动的需要,有序的表达。这就像计算机,虽然安装了许多程序,但是只有与当前任务相关的程序处于运行状态,其余大部分程序原地待命。那么,人体怎样对众多的细胞进行组织协调,构成一个统一的生物体呢?