与此同时,新技术面临的社会伦理压力与舆论挑战也日益严峻。事实上,在生命科学发展的漫漫征途中,从来都不缺少质疑和对立。今天,围绕转基因和基因编辑等技术的伦理与道德,产生了许许多多的争议。科技发展将遭受伦理的挑战,而社会固有的道德伦理也未尝不会被科技重塑。技术本没有善恶之分,而是否会给未来世界带来深重灾难最终取决于我们人类自身。斯特普托于1988年3月21日逝世。......
2023-10-28
1971年,吴瑞将引物延伸(primer extension)用于DNA测序,启发了后人的测序研究,成为Sanger测序法的重要一步,而引物延伸也被用于其他两项诺贝尔奖工作,即凯利·穆利斯的PCR(聚合酶链式反应)和迈克尔·史密斯的定点突变。
1975年,桑格和考尔森发明了基于合成的加减测序法。桑格使用该法在1977年测定了第一个基因组,它是由5375个核苷酸组成的一种病毒——φX174噬菌体。1977年2月,阿兰·迈克塞姆与沃尔特·吉尔伯特发表了基于化学降解的测序法(chemical degradation method),这是第一个被广泛采用的测序技术,可以认为是第一代DNA测序法。
同年12月,桑格发表了后人尊称为Sanger测序法的链终止测序法(dideoxy chain-termination method)。Sanger测序法依赖于一类具有特殊本领的双脱氧核苷酸,它们能够伪装成普通核苷酸并阻断正在复制过程中的DNA链的进一步延伸。而后,通过读取该末端位置核苷酸的荧光信号,就可以读取模板DNA上相对应位置的核苷酸序列,即每添加一个碱基,反应就被终止,同时进行检测,从而获得每次所添加的与模板链互补碱基的具体信息。Sanger测序法最长能读取1000个核苷酸的DNA序列。与前一种方法相比,它用时更短,完成一次测序只需几十分钟。经过不断改良,Sanger测序法的错误率低至十万分之一。由此,人类获得了窥探生命遗传变异本质的能力。
通过改良标记方法、电泳技术、自动化等重要技术环节,Sanger测序法得到了普遍应用,帮助人类开启了基因组学时代。利用Sanger测序法,人们完成了人、小鼠、水稻、大豆等多个物种的全基因组测序。2001年,在历时13年,耗资38亿美元,经由6个国家(美、英、法、德、日、中)的数百位科学家和技术人员的努力,第一个人类基因组草图最终完成,并得以正式发表。
尽管经过了各种改良,第一代测序技术还是存在通量低、成本高的问题,技术特点决定了其应用范围。与此同时,来自微流控技术和光电微制造等领域的进展激励着人们探索下一代测序技术(Next Generation Sequencing,简称NGS,也称二代测序技术)。(www.chuimin.cn)
率先出现并实现商用的NGS测序技术克服了通量低和成本高的缺点。而且,BGISEQ-500等二代测序仪采用DNA纳米球技术,以生成大量的模板DNA,也在一定程度上克服了扩增偏倚现象[1]。NGS测序可以一次性测序几十万到上亿条DNA分子,大大提升了测序实验通量,同时有效降低了测序成本。不过,其单次检测的DNA长度偏低,介于150到250个碱基(已经退市的罗氏454技术可以检测到几百个碱基)。
2011年,完成一个人的全基因组测序只需要一周左右的时间,成本已经降到1万美元。2016年,拥有自主知识产权的国产测序仪BGISEQ-500平台创造了600美元个人全基因组测序的低成本新纪录。预计到2020年,用不超过300美元的成本,就能在24小时内完成个人全基因组样本制备、测序和数据分析全过程。二代测序以其技术的便捷和成本的低廉几乎彻底改变了整个生命科学前沿研究和应用的模式,并带动了配套及相关技术的发展和产业应用。
在NGS蓬勃发展的同时,第三代测序技术也悄然出现,并快速发展。三代测序技术的特点是检测灵敏,单个DNA分子就能够进行信号检测,而无须模板DNA的大量拷贝来形成模板簇同步信号,从而避免了PCR过程中的扩增偏倚。Oxford Nanopore Technologies纳米孔单分子测序技术(single-molecule seguencing)和PacBio的零模波导孔(Zero-Mode Waveguides,ZMW)单分子实时测序技术成为三代测序技术的两大代表。目前,PacBio的Sequel测序仪读长平均可达12Kbp(千碱基对)以上,而Nanopore的GridION测序仪读长平均可达25Kbp以上。甚至,有报道宣称这类测序仪最高读长可以高达上百万个碱基,这给人类发现长片段DNA造成的遗传变异疾病提供了可能,为从头构建全新参考基因组提供了强有力的工具。
总之,人类永远不会满足于现状。作为一个新兴且快速发展的领域,以测序技术为代表的生物样品数字化技术和其应用,必将保持高速发展的态势,为人类理解生命科学奥妙,提高生活质量,保护生物多样性等提供更快、更好、更便宜的工具。
有关生命密码: 你的第一本基因科普书的文章
与此同时,新技术面临的社会伦理压力与舆论挑战也日益严峻。事实上,在生命科学发展的漫漫征途中,从来都不缺少质疑和对立。今天,围绕转基因和基因编辑等技术的伦理与道德,产生了许许多多的争议。科技发展将遭受伦理的挑战,而社会固有的道德伦理也未尝不会被科技重塑。技术本没有善恶之分,而是否会给未来世界带来深重灾难最终取决于我们人类自身。斯特普托于1988年3月21日逝世。......
2023-10-28
1859年,达尔文在《物种起源》中首次提出“演化论”观点,世界上现存的数百万个物种,是从大约30多亿年前的原始生命开始不断演化的结果。中国民间流传着“同姓的人500年前是一家”的说法。他们可以根据毛发、血液等痕迹,通过基因检测技术来确认犯罪嫌疑人的身份。自20世纪70年代以来,基因测序技术已经成为打开基因宝藏的金钥匙,帮助我们揭开了无数令人惊叹的生命奥秘。......
2023-10-28
尹烨是我的一位科学家朋友,我们常会交流对科学问题的看法。不得不说,他是一个很认真的人。世上最怕认真二字,科学尤其如此,但也往往最需要认真的精神。最近尹烨出了本名为《生命密码》的新书,里面包含了40余篇与生命有关的文章,话题领域涵盖动植物、微生物和人,足以满足对生命科学感兴趣的人的好奇心。开卷有益,愿大家如尹烨一样,赤子之心永存,对生命充满好奇。......
2023-10-28
每个人的细胞,都是携带着巨大DNA的数据宝库。不过,目前的DNA取证技术绝非万能。要识别DNA表观遗传差异,并非做不到。如果一切如开篇电影《三块广告牌》中的母亲米尔德里所愿,将全国男人的DNA都抽取一遍,那便和日本小说家东野圭吾笔下的《白金数据》一样了。在这本书中,未来政府会建立基因数据库,收集全国人民的DNA数据,通过与犯罪分子留在现场的DNA进行比对,警方可以快速准确地确定真凶或者受害者的身份。......
2023-10-28
群体技术、个体技术、群体伦理、个体伦理,始终是生命科学需要回答的问题。在过去异想天开,在今天勉为其难,在未来习以为常,尹烨说这就是“技术”。“自在睡觉”是为生命赋能的一个团队。尹烨两年半的坚持,成就了《天方烨谈》这样一个科普品牌,音频节目播放量高达3000万。而这本《生命密码》,不仅是中国本土的第一本基因科普书,也是尹烨本人探索生命科学领域的第一本趣味之作。生命是一种积累,而创作和阅读帮助人们积累。......
2023-10-28
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2023-10-28
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2023-10-28
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2023-10-28
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