许多研究者对此进行了研究，并提出了多种差异表达基因检测方法。OPA方法采用基因组数据异常分析的非参数方法对某特定基因进行检测，这个基因的基因芯片数据的一个组中只有一部分样本相对于另一组样本过高表达，剩余的样本没有差异表达的迹象。PACK方法、PADGE方法、PPRM方法、OPA方法、LRS方法也研究了假定癌症组子集样本相对于正常组样本有过高或过低表达的差异基因表达检测统计方法。......
2023-11-21
蚂蚁基因表达的不同导致分工差异
【摘要】：起初，蚁后是一群蚂蚁中一些生来不同的雌蚁，被称为“公主”，从蛹中羽化出来就生有翅，而且有生殖能力。在一个蚁群中，除了雄蚁之外，“公主”、工蚁、兵蚁都是雌蚁，也都是同一个蚁后的“女儿”，有着相同的基因。蚂蚁虽然基因相同，却在后天的发育过程中，有的成了继承皇位的“公主”，有的成了操持家务的“保姆”，有的干脆变成了“女兵”。这进一步说明，蚂蚁分工差异的原因是基因表达的不同，而非基因本身的不同。
宋代诗人杨万里写过一首《观蚁》：“偶尔相逢细间途，不知何事数迁居。微躯所馔能多少，一猎归来满后车。”
蚂蚁被认为是“超个体”，如果把一个蚁群看成一个人脑，每个蚂蚁个体就相当于人脑中的一个神经元，它们可以组成一个团体，互相配合来完成许多工作。
几乎每种蚂蚁都过着分工井然、有条不紊的群居生活 一个蚁群基本上有这么几种蚂蚁：雄蚁、蚁后、工蚁和兵蚁。
雄蚁生来的使命就是繁殖，它是由未受精卵发育成的生殖蚁。与之类似，蚁后的主要工作也是繁殖及养育后代。起初，蚁后是一群蚂蚁中一些生来不同的雌蚁，被称为“公主”，从蛹中羽化出来就生有翅，而且有生殖能力。等到生殖腺充分发育后，它们与雄蚁远离蚁巢进行群体婚飞，也就是交配。交配结束后，雄蚁便完成使命光荣地死去。而“公主”也会将双翅脱落，并在土壤中掘穴建巢，开始建立自己的蚁群，成为蚁后。蚁后个体特别大，一般会有工蚁伺候。
工蚁又称职蚁，顾名思义就是干活的蚂蚁，它们个体最小但数量最多，是没有生殖能力的雌性，主要职责是建造和扩大巢穴、采集食物、饲喂幼蚁及蚁后等。
兵蚁也是雌蚁，负责抵抗外敌，同样没有繁殖能力，但体形较大，上颚发达，战斗力很强。
在一个蚁群中，除了雄蚁之外，“公主”、工蚁、兵蚁都是雌蚁，也都是同一个蚁后的“女儿”，有着相同的基因。(www.chuimin.cn)
大多数生物都想方设法把自己的DNA传递下去，但是作为真社会性昆虫，蚂蚁存在的意义并非是为了个体DNA的传递，而是要保障群体DNA的传递。为此，一些个体放弃了繁殖能力，服从社会分工——当有繁殖能力的姐妹顺利繁殖后，它们的DNA也就获得了传递。不过，在DNA相同的情况下，蚂蚁又是如何发育成不同工种的呢？
人类拥有相同的基因会发育成极其相似的同卵双胞胎。蚂蚁虽然基因相同，却在后天的发育过程中，有的成了继承皇位的“公主”，有的成了操持家务的“保姆”，有的干脆变成了“女兵”。造成“同蚁不同命”现象的，便是它们后天发育中的基因表达调控——通过改变环境、食物等因素影响基因表达。
在蚂蚁发育的过程中，不同工种的基因表达不同，因而表现出在生理构造、体形和行为等方面的差异。这种基因不变，而基因表达出现可遗传变化的现象，称为表观遗传。
在研究佛罗里达弓背蚁时，美国科学家发现H3K27ac的基因[1]决定了蚂蚁的分工。如果抑制兵蚁体内该基因的表达，这些兵蚁便会一改“女兵”作风，开始充当蚁群的“保姆”，像工蚁一样专心觅食。这进一步说明，蚂蚁分工差异的原因是基因表达的不同，而非基因本身的不同。
这种基因表达的差异能让蚁群更好地适应环境。在食物丰沛时，少数工蚁便能找到足够的食物，蚁群可以分配更多蚂蚁去保卫巢穴；而在食物短缺时，会有更多的蚂蚁加入觅食的队伍。
依靠群体的力量，小小的蚂蚁能够进行各种需要高度社会分工合作的活动。不少蚂蚁都是建筑能手，巢穴内部复杂程度与人类建筑不相上下；有的蚂蚁从别的蚁巢偷取幼虫蓄奴使用；有的蚂蚁有特殊工种，专门以腹部储存蜜汁以供蚁群使用。最令人惊奇的是，有些蚂蚁甚至还会从事“农牧业”活动。
有关生命密码： 你的第一本基因科普书的文章
- 详细阅读
-
差异表达基因检测数据分析结果详细阅读
差异表达基因检测不仅具有统计学意义，而且具有生物学意义，在医学临床诊断、药物疗效判断、揭示疾病发生机制等方面都有重要的作用。在医学研究中，癌症差异表达基因检测就是一个重要的问题。差异表达基因检测统计方法的目的是识别由于实验环境变化而引起的表达水平改变的基因［43］。在基因芯片数据分析中，差异表达基因检测的传统方法通常是假定所有癌症组样本相对于正常组样本都具有过高或过低的表达。......
2023-11-21
-
差异表达基因数据集详解详细阅读
真实数据的乳腺癌基因寻找结果采用乳腺癌的数据，即包含7 129个基因，49个乳腺癌样本，其中正常组样本数为25，癌症组样本数为24。单基因水平研究标准化最简单的方法是从所有log-ratios强度扣除一个它们值的均值或中值的常数，以实现数据转换［47］。......
2023-11-21
-
差异表达基因检测方法研究详细阅读
发现差异表达基因是微阵列实验研究的主要目的之一［44-47］。传统的差异表达基因检测方法基于癌症组所有样本的基因表达强度一致地为过高或过低表达这样一个假定［69，70］，如传统的T统计方法是对比两组表达值分布的均值，从而检测其差异［25］。差异表达基因检测方法不仅在统计量方面发展迅速，而且加强了对FDR错误发现率的控制，以减少假阳性并充分发挥数据分析的作用［71，72］。常用的传统差异表达基因检测方法如下。......
2023-11-21
-
差异表达基因检测方法总结及改进研究详细阅读
差异表达基因检测可以寻找相对于正常组织过高或过低调节的癌症组织，在医学临床诊断、药物疗效判断、揭示癌症疾病发生机制等方面都有重要的作用。本书总结了Tomlins等人关于癌症组样本子集过表达的差异表达基因检测统计方法，同时通过模拟研究和真实数据的检验，比较分析了这些差异表达基因检测方法，并提出了改进的差异表达基因检测方法。......
2023-11-21
-
算法分析-差异表达基因检测方法的比较分析详细阅读
在COPA方法的基础上，Tibshirani等人在2007年提出的OS方法引入了分位数做启发式规则附加表达值，进行差异表达基因检测。由于差异估算中用正常组样本中值代替了全部数据的中值，ORT方法比COPA方法和OS方法恰当地估计了两组数据的差异。COPA方法和OS方法随差异数目的增加，性能有所降低。Lian在2008年提出的MOST方法隐性地考虑了差异基因表达强度临界值所有可能的取值，通过确定其统计量最大值来确定阈值，从而检测差异表达基因。......
2023-11-21
-
差异表达基因检测数据分析成果研究详细阅读
在国外涉及较早的变点研究是突变点，对于渐变式变点的研究也有一些结论，对于位置参数模型提出了变点的最小二乘法的估计。最小二乘法就是以观察值和理论值之差的平方和作为目标函数，将其达到极小值的点作为有关参数的点估计［8］。给出衡量最小二乘法识别多差异表达基因检测突变点能力的方法，模拟研究最小二乘法对不同具有差异表达基因的基因表达谱数据生成过程的多差异表达基因变点检测效果［10］。......
2023-11-21
-
差异表达基因检测样本子集的统计方法详细阅读
2005年，Tomlins等人发现了一种不同的差异表达模型，一些致癌基因只在癌症组样本的一小部分中存在异常，这类基因的差异表达检测需要考虑癌症组样本子集相对于正常组样本是过表达的，即一个组中的一部分样本相对于另一个组样本有过高或过低的差异表达，这引起了许多学者的广泛关注［99］。基于假定癌症组所有样本相对于正常组样本都有过高或过低表达的差异表达基因检测统计方法，没有考虑到癌症基因的活化性特点。......
2023-11-21
相关推荐