而让科学入土生根，走进千家万户，就是科普的使命。自2006年以来，华大基因每年都会主办国际基因组学大会，而“科学嘉年华”正是大会的永恒主题之一。在2017年的第十二届国际基因组学大会上，尹烨及其团队精心策划了这一届的“科学嘉年华”活动，以“科学是甜美的”为口号，场面特别火爆。作为嘉宾之一，我跟孩子们谈到了生命的本质和意义，聊到了他们的爱好和梦想，还跟孩子们说，科学是甜蜜蜜的，科学是美丽的，科学是可以享受的。......
2023-10-28
生命密码：巨型基因组有多大？
【摘要】：同时，在基因组测序和组装领域，挑战解码最大的基因组序列也是人们孜孜不倦地解读大自然生命杰作的重要关注点。）事实上，巨型基因组并不多见，大多数真核基因组都比较小。受当前检测技术限制，目前关于这些巨型基因组的结构和功能远未深入研究。以迄今为止报道的最大的基因组日本重楼为例，其基因组大小接近150Gb，约为人类基因组的50倍。
到目前为止，已发现的最小生命基因组（不包括病毒）只有0.0005pg（0.5Mb），来自布氏菌属；已报道的最小真核生命基因组来自寄生在一些哺乳动物的微孢子虫，约为2.25Mb；而最大的基因组来自植物界的日本重楼，也叫衣笠草，约为148.8Gb（前纪录保持者石花肺鱼的基因组大小约为132.8Gb），最大的真核基因组与最小的真核基因组之间的差距约为64000倍。这些记录基本达到了一个能行使正常生存繁殖功能的生命极限。
过去几十年，合成生物学致力于能够合成最小的功能基因组，这一直以来是人类试图证明“上帝扮演者”身份的重要尝试。同时，在基因组测序和组装领域，挑战解码最大的基因组序列也是人们孜孜不倦地解读大自然生命杰作的重要关注点。在这里，我们更多地探讨一下“巨型基因组”的问题，且主要关注基因组大小多样性最丰富的植物类群。
巨型基因五大门类
（横轴为各门类中基因大小的数值范围；横向排布的轴线宽度代表各门类物种基因组不同数值大小出现的相对频率。数据引自Hidalgo et al.，Is There an Upper Limit to Genome Size？）(www.chuimin.cn)
事实上，巨型基因组并不多见，大多数真核基因组都比较小（真核生物多样性极高，动植物仅仅是真核生命中极小的两个分支）。纵观所有真核生物，确有超过十多个物种基因组大小超过了100Gb（约占已知基因组大小物种的0.09%），来源于5个真核门类：一个来源于蕨类（Psilotales），两个来源于开花植物（Liliales和Santalales），两个来源于脊椎动物（Lepidosireniformes/lungfish和Urodela/salamanders）。受当前检测技术限制，目前关于这些巨型基因组的结构和功能远未深入研究。
以迄今为止报道的最大的基因组日本重楼为例，其基因组大小接近150Gb，约为人类基因组的50倍。而实际上，日本重楼是个异源杂合的8倍体，这也暗示其细胞核中包含了将近1200Gb（150Gb×8）的碱基大小。一个碱基的长度约为0.34纳米，人类基因组单倍体的所有碱基连在一起约为1米（整个二倍体细胞的碱基连接起来是2米），而日本重楼单倍体的所有碱基连在一起长达50米，单个细胞核所有DNA碱基连在一起长达400米。很难想象这么巨量的遗传物质如何有效地组装在一个只有几微米级别的细胞核里。日本重楼生长速度极慢，这与其巨量遗传物质在每次DNA复制和细胞分裂中完成一次周期需要消耗的能量之大有关系。与此同时，这也引发我们进行相应的思考：150Gb的基因组大小是否是生命能承受的极限？单条染色体大小的极限会是多少？
有关生命密码： 你的第一本基因科普书的文章
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1859年，达尔文在《物种起源》中首次提出“演化论”观点，世界上现存的数百万个物种，是从大约30多亿年前的原始生命开始不断演化的结果。中国民间流传着“同姓的人500年前是一家”的说法。他们可以根据毛发、血液等痕迹，通过基因检测技术来确认犯罪嫌疑人的身份。自20世纪70年代以来，基因测序技术已经成为打开基因宝藏的金钥匙，帮助我们揭开了无数令人惊叹的生命奥秘。......
2023-10-28
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《生命密码：基因科普书》详细阅读
群体技术、个体技术、群体伦理、个体伦理，始终是生命科学需要回答的问题。在过去异想天开，在今天勉为其难，在未来习以为常，尹烨说这就是“技术”。“自在睡觉”是为生命赋能的一个团队。尹烨两年半的坚持，成就了《天方烨谈》这样一个科普品牌，音频节目播放量高达3000万。而这本《生命密码》，不仅是中国本土的第一本基因科普书，也是尹烨本人探索生命科学领域的第一本趣味之作。生命是一种积累，而创作和阅读帮助人们积累。......
2023-10-28
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解密生命密码：基因科普书详细阅读
每个人的细胞，都是携带着巨大DNA的数据宝库。不过，目前的DNA取证技术绝非万能。要识别DNA表观遗传差异，并非做不到。如果一切如开篇电影《三块广告牌》中的母亲米尔德里所愿，将全国男人的DNA都抽取一遍，那便和日本小说家东野圭吾笔下的《白金数据》一样了。在这本书中，未来政府会建立基因数据库，收集全国人民的DNA数据，通过与犯罪分子留在现场的DNA进行比对，警方可以快速准确地确定真凶或者受害者的身份。......
2023-10-28
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生命密码与计算机密码的惊人相似详细阅读
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2023-11-03
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或许，这些生命已到访过地球，却在返乡之后走向了毁灭。人类及目前推测出的大约870万种地球生命，在这浩渺宇宙中，在这有限认知内，成了一棵绝无仅有的“独苗”。然而，这棵独苗是否能继续存在，前景尚不明朗。最起码，我们应当明白，人类之于万千物种，不过是沧海一粟。“仰观宇宙之大，俯察品类之盛。”对自然怀有敬畏，牢记人性之本，明天才会更加美好。[1]一个地质学上的概念，开始于地球形成之初，结束于38亿年前。......
2023-10-28
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神奇的位点：生命密码解读详细阅读
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2023-10-28
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2023-10-28
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