如果咱们玩斗地主,78910JQK,这个序列是有意义的,在扑克牌里叫顺子,在基因组里可类比于一个基因。现在你明白了吧,说一个物种基因组有多大,就是问这个物种有多少张“扑克牌”,也即多少个碱基对。460Mb,也就是4.6亿对;大豆的基因组有多大啊?1Gb,大约是10亿对;那小麦的基因组呢?你可能有点儿混乱了,难道不是物种越高等,基因组就越大么?物种的基因组大小和它的复杂性之间没有严格的对应关系,这个现象被称为“C值悖论”。......
2023-10-28
我们终于可以正经地讲讲基因组了。基因组是生命的源代码,是细胞内所有的遗传信息的总和,是指导物种生长、发育和繁衍的基本程序。
30多亿年前,生命的第一个完整基因组诞生,它具有了复制、变异和遗传的特性,从诞生之日起便在这个星球上以不可阻挡的力量扩散和传承,形成了今天众多已知和未知的丰富多彩的生命形式。这些栖息于不同生命载体的基因组在时间和空间中有着无穷的多样性,基因组大小的变异就是其中之一。这个大小,我们用C值表示。
C值,即每一种生物的单倍体基因组DNA总量,或者通俗一点理解,也就是这个物种的所有扑克牌,即所有碱基对加在一起有多重。我们一般用皮克(pg,10-12克)表示,1pg的重量约等于1Gb(10亿个)的碱基对。虽然生命大致还是遵循了从简单到复杂、从低等到高等的演化模式,但正如刚才列举的例子,基因组大的物种并不一定更高等。
日前研究结果显示,对于每个生命大分支(细菌、真菌、动物、植物、藻类和原虫等),基因组大小与生命复杂度之间并没有绝对的相关性,“低等”生命可能拥有极大基因组,而“高等”生命的基因组可能小巧而精致,这就是物种之间基因组大小变异的C值悖论。这似乎与我们的感性认识不相符合。
示意图:陆生植物的基因组大小分布
(内圈是以苔藓植物为起点构建的陆生植物系统发育树,最小分支单元为科,各科按演化出现的时间先后顺序在图中逆时针排布;外圈有色条柱,高度代表该科平均基因组大小,单位Gb;内圈加粗的灰色分支对应的外圈基因组大小数值暂缺。数据引自:Jaume Pellicer,et al.,Genome Size Diversity and Its Impact on the Evolution of Land Plants)(www.chuimin.cn)
表面上看,我们会认为基因组越大的物种,越可能拥有更复杂、更高等的生命形式。然而,这就如同单看国土面积并不能和GDP(国内生产总值)成正比一样,GDP与该国的科技水平、人口组成、经济构成甚至宗教文化都有关系,谁也不知道国土面积数字背后是否为不宜居住和种植的沙漠或极寒地带。
另外,C值悖论与达尔文的演化论和自然选择理论也是不吻合的。人类基因组大小约是水稻基因组大小的七倍,却只有小麦基因组的约五分之一,在自然界的生命体中处于一个中间值位置,但人类却拥有无可比拟的语言沟通、劳动创造及建立社区和国家的能力。这就常常引起人们的思考:如果不是因为拥有超大或超复杂的基因组,又是什么让人类不同于其他生命脱颖而出,进而站在生命金字塔的顶端而主宰地球的?这是一个人类相关领域学家都关心的有趣问题。
而物种内部不同亚种之间,基因组大小各个层面的变异,却往往与很多重要表型性状相关联。而这些变异绝大多数来源于功能未知的异质染色质和非编码区域,也就是我们刚才提到的基因组中“暗物质”的部分。
有关生命密码: 你的第一本基因科普书的文章
如果咱们玩斗地主,78910JQK,这个序列是有意义的,在扑克牌里叫顺子,在基因组里可类比于一个基因。现在你明白了吧,说一个物种基因组有多大,就是问这个物种有多少张“扑克牌”,也即多少个碱基对。460Mb,也就是4.6亿对;大豆的基因组有多大啊?1Gb,大约是10亿对;那小麦的基因组呢?你可能有点儿混乱了,难道不是物种越高等,基因组就越大么?物种的基因组大小和它的复杂性之间没有严格的对应关系,这个现象被称为“C值悖论”。......
2023-10-28
4 种植物各器官δ13C 值与RWC、LWC、脯氨酸含量、叶水势之间具有显著的相关性,但没有一致的规律,存在明显的种间差异。蒙古冰草叶片的δ13C 值与根的δ13C 值未达到显著正相关,与RWC 具有显著负相关关系;生理指标之间,RWC 与LWC、WP 显著正相关;Proline 与WP 显著负相关。总的来看,4 种植物各器官的δ13C 值之间互为正相关,与Proline 显著正相关,与RWC、WP 显著负相关。......
2023-11-04
甘草、牛枝子和蒙古冰草的δ13C 值与脯氨酸含量具有显著正相关,而短花针茅的δ13C 值与脯氨酸含量之间的相关性未达到显著水平。叶温与光合速率、气孔导度、胞间CO2 浓度、蒸腾速率之间具有极显著负相关,与RWC 显著负相关,与脯氨酸含量显著正相关。......
2023-11-04
同时,在基因组测序和组装领域,挑战解码最大的基因组序列也是人们孜孜不倦地解读大自然生命杰作的重要关注点。)事实上,巨型基因组并不多见,大多数真核基因组都比较小。受当前检测技术限制,目前关于这些巨型基因组的结构和功能远未深入研究。以迄今为止报道的最大的基因组日本重楼为例,其基因组大小接近150Gb,约为人类基因组的50倍。......
2023-10-28
系统标准库中有许多返回指针值的函数,如字符串处理、存储分配等标准库函数。返回指针值的函数的调用与普通函数的参数传递相同,所不同的是需要定义一个与其返回值数据类型相同的指针变量来接收返回值。求,要求使用静态局部变量和返回指针的函数方式进行处理。返回指针值函数设计最重要的一点是其返回值(指针),总体原则是:返回的指针所对应的内存空间不能因该指针函数的返回而被释放掉。......
2023-11-20
但由于主观和客观因素的限制,仍然有很多问题有待深入研究。在今后的研究中,可以就以下几个方面展开进一步的探讨。建筑全生命周期的过程参数与清洁性的相关性研究。在下一阶段,对本书所构建的清洁性测度模型展开进一步的实证研究。更进一步地,可通过定量化的研究揭示其内在相关性的大小,为扩大清洁生产实施的范围提供更具体的依据。......
2023-06-20
但在吊车梁按正常使用极限状态设计时,可采用吊车荷载的准永久值。排架柱A在支承吊车梁的牛腿部位由两台吊车运行至相近位置时,则可算得牛腿面上由吊车最大轮压产生的最大竖向反力标准值Rmax=____kN。计算时考虑两台吊车且每一车轮上均作用横向水平荷载h,相应地按1.3.2节的规定,取用多台(两台)吊车的水平荷载标准值折减系数0.9。......
2023-08-28
本研究中缺失值填补后的平均AOD 水平显著高于填补前的平均AOD 水平。从最终随机森林模型的自变量重要性顺序来看,补缺后的AOD 值和环境PM2.5 浓度具有较强的相关性。该地区与上海市西部直接接壤,因此其污染物扩散趋势可能影响上海市PM2.5 浓度的分布。最后,本模型具有较高的空间分辨率,可有效反映PM2.5 的空间变异,从而减少人群分布集中的流行病学研究中暴露错分的可能性。......
2023-11-17
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