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基因克隆中的转化与阳性筛选

【摘要】:向管中加入1 mL LB液体培养基,混匀后37℃振荡培养1 h,使细菌恢复正常生长状态,并表达质粒编码的抗生素抗性基因。(五)阳性克隆的筛选阳性克隆的筛选是指用PCR或酶切的方法对阳性克隆进行初步鉴定。阳性克隆经过初步鉴定后,需要对插入片段进行测序分析以确定其正确与否。菌液PCR:取10 μL菌液,加入含100μL水的Eppendorf管中,100℃煮沸20 min。取出10 μL煮沸后的溶液作为PCR的模板,进行菌液PCR。挑取单克隆,摇菌,提取质粒。

(一)确定基因工程表达系统

用于干扰素基因表达的宿主可分为两大类:原核细胞——大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、链霉菌;真核细胞——酵母、丝状真菌、哺乳动物细胞。常见基因工程表达系统见表2-4-1。基因工程菌株选择原则如下:具备宿主细胞的特征和生产干扰素的能力,首先保证表达的蛋白质的功能,其次是表达的量和分离纯化的难易。

表2-4-1 大肠杆菌、酵母和哺乳动物细胞3类常见基因工程表达系统

(二)受体菌的培养(以E.coli DH 5α为例)

从LB平板上挑取新活化的E.coli DH 5α单菌落,接种于3~5 mL LB液体培养基中,37℃下振荡培养12 h左右,直至对数生长后期。将该菌悬液以1∶(50~100)的比例接种于100 mL LB液体培养基中,37℃振荡培养2~3 h至A600为0.5左右。

(三)制备感受态细胞(CaCl2法)

(1)CaCl2溶液配制:50 mL水中加入CaCl2粉末7.351 g。高压灭菌,4℃保存。

(2)取菌体培养液1 mL于1.5 mL微型管中。

(3)用冷冻离心机4℃下,1500 r/min离心5 min,弃上清液,沥干残液。

(4)在每个微型管中加入100μL冰中预冷的CaCl2溶液,轻晃悬浮菌体。

(5)用冷冻离心机4℃下,1500 r/min离心5 min,弃上清液,沥干残液。

(6)在每个微型管中加入100 μL冰中预冷的CaCl2溶液,轻晃悬浮菌体。-70℃冰箱保存备用。

(四)转化

(1)从-70℃冰箱中取200 μL感受态细胞悬液,室温下使其解冻,解冻后立即置于冰上。

(2)加入pBS质粒DNA溶液(含量不超过50 ng,体积不超过10μL),轻轻摇匀,冰上放置30 min。

(3)42℃水浴中热击90 s或37℃水浴5 min,热击后迅速置于冰上冷却3~5 min。

(4)向管中加入1 mL LB液体培养基(不含Amp),混匀后37℃振荡培养1 h,使细菌恢复正常生长状态,并表达质粒编码的抗生素抗性基因(Ampr)。

(5)将上述菌液摇匀后取100 μL,涂布于含Amp的筛选平板上,正面向上放置半小时,待菌液完全被培养基吸收后倒置培养皿,37℃培养16~24 h。待出现明显而又未相互重叠的单菌落时拿出平板。

(6)4℃下放置数小时,使显色完全。

(五)阳性克隆的筛选

阳性克隆的筛选是指用PCR或酶切的方法对阳性克隆进行初步鉴定。PCR检测包括对菌液直接进行PCR检测或将转化菌落(重组子)扩大培养提取质粒后再进行PCR检测。阳性克隆经过初步鉴定后,需要对插入片段进行测序分析以确定其正确与否。

(1)菌液PCR:取10 μL菌液,加入含100μL水的Eppendorf管中,100℃煮沸20 min。取出10 μL煮沸后的溶液作为PCR的模板,进行菌液PCR。

(2)挑取单克隆,摇菌,提取质粒。酶切鉴定。测序分析。

(六)目的蛋白鉴定

保存的菌体可进一步用蛋白质提取方法提取蛋白质,经SDS-PAGE检测表达蛋白或进行Western印迹杂交分析。流程如下:SDS-PAGE电泳分离蛋白质;将蛋白质转印至膜上;封闭非特异性结合位点;膜与目的蛋白特异性抗体孵育;加入显色底物显色或与化学发光试剂孵育、曝光显影。

1.结合所查资料,确定使用哪一种基因工程表达系统。

2.确定如何构建基因工程菌并实施。

3.比较各种载体的优劣,选择合适的载体。

4.制备感受态细胞有哪些方法?分别如何制备?

5.筛选阳性克隆的方法和原理有哪些?确定一到两种筛选方法并实施。

6.目的蛋白鉴定的方法和原理有哪些?确定一到两种筛选方法并实施。

7.查找DNA测序的原理和方法。